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perl-BioPerl rpm build for : PCLinuxOS. For other distributions click perl-BioPerl.

Name : perl-BioPerl
Version : 1.6.924 Vendor : (none)
Release : 11pclos2017 Date : 2017-07-11 22:41:06
Group : Development/Perl Source RPM : perl-BioPerl-1.6.924-11pclos2017.src.rpm
Size : 14.79 MB
Packager : bb2 < bb2>
Summary : BioPerl core modules
Description :
Officially organized in 1995 and existing informally for several years
prior, The Bioperl Project is an international association of developers
of open source Perl tools for bioinformatics, genomics and life science
research.

RPM found in directory: /vol/rzm3/linux-pclinuxos/pclinuxos/apt/pclinuxos/64bit/RPMS.x86_64

Content of RPM  Changelog  Provides Requires

Download
ftp.icm.edu.pl  perl-BioPerl-1.6.924-11pclos2017.noarch.rpm
     

Provides :
perl-bioperl
perl(Bio::Align::AlignI)
perl(Bio::Align::DNAStatistics)
perl(Bio::Align::Graphics)
perl(Bio::AlignIO)
perl(Bio::AlignIO::arp)
perl(Bio::AlignIO::bl2seq)
perl(Bio::AlignIO::clustalw)
perl(Bio::AlignIO::emboss)
perl(Bio::AlignIO::fasta)
perl(Bio::AlignIO::Handler::GenericAlignHandler)
perl(Bio::AlignIO::largemultifasta)
perl(Bio::AlignIO::maf)
perl(Bio::AlignIO::mase)
perl(Bio::AlignIO::mega)
perl(Bio::AlignIO::meme)
perl(Bio::AlignIO::metafasta)
perl(Bio::AlignIO::msf)
perl(Bio::AlignIO::nexml)
perl(Bio::AlignIO::nexus)
perl(Bio::AlignIO::pfam)
perl(Bio::AlignIO::phylip)
perl(Bio::AlignIO::po)
perl(Bio::AlignIO::proda)
perl(Bio::AlignIO::prodom)
perl(Bio::AlignIO::psi)
perl(Bio::AlignIO::selex)
perl(Bio::AlignIO::stockholm)
perl(Bio::AlignIO::xmfa)
perl(Bio::Align::PairwiseStatistics)
perl(Bio::Align::ProteinStatistics)
perl(Bio::Align::StatisticsI)
perl(Bio::Align::Utilities)
perl(Bio::AnalysisI)
perl(Bio::AnalysisI::JobI)
perl(Bio::AnalysisParserI)
perl(Bio::AnalysisResultI)
perl(Bio::AnnotatableI)
perl(Bio::Annotation::AnnotationFactory)
perl(Bio::Annotation::Collection)
perl(Bio::AnnotationCollectionI)
perl(Bio::Annotation::Comment)
perl(Bio::Annotation::DBLink)
perl(Bio::AnnotationI)
perl(Bio::Annotation::OntologyTerm)
perl(Bio::Annotation::Reference)
perl(Bio::Annotation::Relation)
perl(Bio::Annotation::SimpleValue)
perl(Bio::Annotation::StructuredValue)
perl(Bio::Annotation::TagTree)
perl(Bio::Annotation::Target)
perl(Bio::Annotation::Tree)
perl(Bio::Annotation::TypeManager)
perl(Bio::Assembly::Contig)
perl(Bio::Assembly::ContigAnalysis)
perl(Bio::Assembly::IO)
perl(Bio::Assembly::IO::ace)
perl(Bio::Assembly::IO::bowtie)
perl(Bio::Assembly::IO::maq)
perl(Bio::Assembly::IO::phrap)
perl(Bio::Assembly::IO::sam)
perl(Bio::Assembly::IO::tigr)
perl(Bio::Assembly::Scaffold)
perl(Bio::Assembly::ScaffoldI)
perl(Bio::Assembly::Singlet)
perl(Bio::Assembly::Tools::ContigSpectrum)
perl(Bio::Cluster::ClusterFactory)
perl(Bio::Cluster::FamilyI)
perl(Bio::ClusterI)
perl(Bio::ClusterIO)
perl(Bio::ClusterIO::dbsnp)
perl(Bio::ClusterIO::unigene)
perl(Bio::Cluster::SequenceFamily)
perl(Bio::Cluster::UniGene)
perl(Bio::Cluster::UniGeneI)
perl(Bio::CodonUsage::IO)
perl(Bio::CodonUsage::Table)
perl(Bio::Coordinate::Chain)
perl(Bio::Coordinate::Collection)
perl(Bio::Coordinate::ExtrapolatingPair)
perl(Bio::Coordinate::GeneMapper)
perl(Bio::Coordinate::Graph)
perl(Bio::Coordinate::MapperI)
perl(Bio::Coordinate::Pair)
perl(Bio::Coordinate::Result)
perl(Bio::Coordinate::Result::Gap)
perl(Bio::Coordinate::ResultI)
perl(Bio::Coordinate::Result::Match)
perl(Bio::Coordinate::Utils)
perl(Bio::Das::FeatureTypeI)
perl(Bio::DasI)
perl(Bio::Das::SegmentI)
perl(Bio::DB::Ace)
perl(Bio::DB::BioFetch)
perl(Bio::DB::CUTG)
perl(Bio::DB::DBFetch)
perl(Bio::DB::EMBL)
perl(Bio::DB::EntrezGene)
perl(Bio::DB::Expression)
perl(Bio::DB::Expression::geo)
perl(Bio::DB::Failover)
perl(Bio::DB::Fasta)
perl(Bio::DB::Fasta::Subdir)
perl(Bio::DB::FileCache)
perl(Bio::DB::Flat)
perl(Bio::DB::Flat::BDB)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::embl)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::fasta)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::genbank)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::swiss)
perl(Bio::DB::Flat::BinarySearch)
perl(Bio::DB::GenBank)
perl(Bio::DB::GenericWebAgent)
perl(Bio::DB::GenPept)
perl(Bio::DB::GFF)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::ace)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::berkeleydb)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::berkeleydb::iterator)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch_oracle)
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perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::caching_handle)
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perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::iterator)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysql)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlace)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlcmap)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlopt)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::oracle)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::oracleace)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::pg)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::pg_fts)
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perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::memory::feature_serializer)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::memory::iterator)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::alignment)
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perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::gene)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::match)
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perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::orf)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::processed_transcript)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::so_transcript)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::transcript)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_acembly)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_ensgene)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_genscan)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_refgene)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_sanger22)
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perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_unigene)
perl(Bio::DB::GFF::Featname)
perl(Bio::DB::GFF::Feature)
perl(Bio::DB::GFF::FeatureIterator)
perl(Bio::DB::GFF::Homol)
perl(Bio::DB::GFF::ID_Iterator)
perl(Bio::DB::GFF::RelSegment)
perl(Bio::DB::GFF::Segment)
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perl(Bio::DB::GFF::Util::Rearrange)
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perl(Bio::DB::MeSH)
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perl(Bio::DB::Qual)
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perl(Bio::DB::Query::WebQuery)
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perl(Bio::DB::RefSeq)
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perl(Bio::DB::SeqFeature::NormalizedFeatureI)
perl(Bio::DB::SeqFeature::NormalizedTableFeatureI)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Segment)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store)
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perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::berkeleydb)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::berkeleydb3)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::berkeleydb::Iterator)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::DBI::Iterator)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::DBI::mysql)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::DBI::Pg)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::DBI::SQLite)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::FeatureFileLoader)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::FeatureIterator)
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perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::GFF3Loader)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::Loader)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::LoadHelper)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::memory)
perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::memory::Iterator)
perl(Bio::DB::SeqHound)
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perl(Bio::DB::Taxonomy::entrez)
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perl(Bio::DB::Taxonomy::list)
perl(Bio::DB::Taxonomy::silva)
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perl(Bio::DB::TFBS::transfac_pro)
perl(Bio::DB::Universal)
perl(Bio::DB::UpdateableSeqI)
perl(Bio::DB::WebDBSeqI)
perl(Bio::DescribableI)
perl(Bio::Draw::Pictogram)
perl(Bio::Event::EventGeneratorI)
perl(Bio::Event::EventHandlerI)
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perl(Bio::Factory::DriverFactory)
perl(Bio::Factory::FTLocationFactory)
perl(Bio::Factory::LocationFactoryI)
perl(Bio::Factory::MapFactoryI)
perl(Bio::Factory::ObjectBuilderI)
perl(Bio::Factory::ObjectFactory)
perl(Bio::Factory::ObjectFactoryI)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactory)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceProcessorI)
perl(Bio::Factory::SequenceStreamI)
perl(Bio::Factory::TreeFactoryI)
perl(Bio::FeatureHolderI)
perl(Bio::HandlerBaseI)
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perl(Bio::Index::AbstractSeq)
perl(Bio::Index::Blast)
perl(Bio::Index::BlastTable)
perl(Bio::Index::EMBL)
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perl(Bio::Index::Fastq)
perl(Bio::Index::GenBank)
perl(Bio::Index::Hmmer)
perl(Bio::Index::Qual)
perl(Bio::Index::Stockholm)
perl(Bio::Index::SwissPfam)
perl(Bio::Index::Swissprot)
perl(Bio::LiveSeq::AARange)
perl(Bio::LiveSeq::Chain)
perl(Bio::LiveSeq::ChainI)
perl(Bio::LiveSeq::DNA)
perl(Bio::LiveSeq::Exon)
perl(Bio::LiveSeq::Gene)
perl(Bio::LiveSeq::Intron)
perl(Bio::LiveSeq::IO::BioPerl)
perl(Bio::LiveSeq::IO::Loader)
perl(Bio::LiveSeq::Mutation)
perl(Bio::LiveSeq::Mutator)
perl(Bio::LiveSeq::Prim_Transcript)
perl(Bio::LiveSeq::Range)
perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Region)
perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Unit)
perl(Bio::LiveSeq::SeqI)
perl(Bio::LiveSeq::Transcript)
perl(Bio::LiveSeq::Translation)
perl(Bio::LocatableSeq)
perl(Bio::Location::Atomic)
perl(Bio::Location::AvWithinCoordPolicy)
perl(Bio::Location::CoordinatePolicyI)
perl(Bio::Location::Fuzzy)
perl(Bio::Location::FuzzyLocationI)
perl(Bio::LocationI)
perl(Bio::Location::NarrowestCoordPolicy)
perl(Bio::Location::Simple)
perl(Bio::Location::Split)
perl(Bio::Location::SplitLocationI)
perl(Bio::Location::WidestCoordPolicy)
perl(Bio::Map::Clone)
perl(Bio::Map::Contig)
perl(Bio::Map::CytoMap)
perl(Bio::Map::CytoMarker)
perl(Bio::Map::CytoPosition)
perl(Bio::Map::EntityI)
perl(Bio::Map::FPCMarker)
perl(Bio::Map::Gene)
perl(Bio::Map::GeneMap)
perl(Bio::Map::GenePosition)
perl(Bio::Map::GeneRelative)
perl(Bio::MapIO)
perl(Bio::MapIO::fpc)
perl(Bio::MapIO::mapmaker)
perl(Bio::Map::LinkageMap)
perl(Bio::Map::LinkagePosition)
perl(Bio::Map::MapI)
perl(Bio::Map::Mappable)
perl(Bio::Map::MappableI)
perl(Bio::Map::Marker)
perl(Bio::Map::MarkerI)
perl(Bio::Map::Microsatellite)
perl(Bio::Map::OrderedPosition)
perl(Bio::Map::OrderedPositionWithDistance)
perl(Bio::Map::Physical)
perl(Bio::Map::Position)
perl(Bio::Map::PositionHandler)
perl(Bio::Map::PositionHandlerI)
perl(Bio::Map::PositionI)
perl(Bio::Map::PositionWithSequence)
perl(Bio::Map::Prediction)
perl(Bio::Map::Relative)
perl(Bio::Map::RelativeI)
perl(Bio::Map::SimpleMap)
perl(Bio::Map::TranscriptionFactor)
perl(Bio::Matrix::Generic)
perl(Bio::Matrix::IO)
perl(Bio::Matrix::IO::mlagan)
perl(Bio::Matrix::IO::phylip)
perl(Bio::Matrix::IO::scoring)
perl(Bio::Matrix::MatrixI)
perl(Bio::Matrix::Mlagan)
perl(Bio::Matrix::PhylipDist)
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perl(Bio::Matrix::PSM::IO)
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perl(Bio::Matrix::PSM::IO::masta)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::meme)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::psiblast)
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perl(Bio::Matrix::PSM::PsmI)
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perl(Bio::Matrix::PSM::SiteMatrixI)
perl(Bio::Matrix::Scoring)
perl(Bio::MolEvol::CodonModel)
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perl(Bio::NexmlIO)
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perl(Bio::OntologyIO)
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perl(Bio::OntologyIO::goflat)
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perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterPro_BioSQL_Handler)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterProHandler)
perl(Bio::OntologyIO::InterProParser)
perl(Bio::OntologyIO::obo)
perl(Bio::OntologyIO::simplehierarchy)
perl(Bio::OntologyIO::soflat)
perl(Bio::Ontology::OBOEngine)
perl(Bio::Ontology::OBOterm)
perl(Bio::Ontology::Ontology)
perl(Bio::Ontology::OntologyEngineI)
perl(Bio::Ontology::OntologyI)
perl(Bio::Ontology::OntologyStore)
perl(Bio::Ontology::Path)
perl(Bio::Ontology::PathI)
perl(Bio::Ontology::Relationship)
perl(Bio::Ontology::RelationshipFactory)
perl(Bio::Ontology::RelationshipI)
perl(Bio::Ontology::RelationshipType)
perl(Bio::Ontology::SimpleGOEngine::GraphAdaptor)
perl(Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine)
perl(Bio::Ontology::Term)
perl(Bio::Ontology::TermFactory)
perl(Bio::Ontology::TermI)
perl(Bio::ParameterBaseI)
perl(Bio::Perl)
perl(Bio::Phenotype::Correlate)
perl(Bio::Phenotype::Measure)
perl(Bio::Phenotype::MeSH::Term)
perl(Bio::Phenotype::MeSH::Twig)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::MiniMIMentry)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentry)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentryAllelicVariant)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMparser)
perl(Bio::Phenotype::Phenotype)
perl(Bio::Phenotype::PhenotypeI)
perl(Bio::PhyloNetwork)
perl(Bio::PhyloNetwork::Factory)
perl(Bio::PhyloNetwork::FactoryX)
perl(Bio::PhyloNetwork::GraphViz)
perl(Bio::PhyloNetwork::muVector)
perl(Bio::PhyloNetwork::RandomFactory)
perl(Bio::PhyloNetwork::TreeFactory)
perl(Bio::PhyloNetwork::TreeFactoryMulti)
perl(Bio::PhyloNetwork::TreeFactoryX)
perl(Bio::PopGen::Genotype)
perl(Bio::PopGen::GenotypeI)
perl(Bio::PopGen::HtSNP)
perl(Bio::PopGen::Individual)
perl(Bio::PopGen::IndividualI)
perl(Bio::PopGen::IO)
perl(Bio::PopGen::IO::csv)
perl(Bio::PopGen::IO::hapmap)
perl(Bio::PopGen::IO::phase)
perl(Bio::PopGen::IO::prettybase)
perl(Bio::PopGen::Marker)
perl(Bio::PopGen::MarkerI)
perl(Bio::PopGen::PopStats)
perl(Bio::PopGen::Population)
perl(Bio::PopGen::PopulationI)
perl(Bio::PopGen::Simulation::Coalescent)
perl(Bio::PopGen::Simulation::GeneticDrift)
perl(Bio::PopGen::Statistics)
perl(Bio::PopGen::TagHaplotype)
perl(Bio::PopGen::Utilities)
perl(Bio::PrimarySeq)
perl(Bio::PrimarySeq::Fasta)
perl(Bio::PrimarySeqI)
perl(Bio::PullParserI)
perl(Bio::Range)
perl(Bio::RangeI)
perl(Bio::Restriction::Analysis)
perl(Bio::Restriction::Enzyme)
perl(Bio::Restriction::EnzymeCollection)
perl(Bio::Restriction::EnzymeI)
perl(Bio::Restriction::Enzyme::MultiCut)
perl(Bio::Restriction::Enzyme::MultiSite)
perl(Bio::Restriction::IO)
perl(Bio::Restriction::IO::bairoch)
perl(Bio::Restriction::IO::base)
perl(Bio::Restriction::IO::itype2)
perl(Bio::Restriction::IO::prototype)
perl(Bio::Restriction::IO::withrefm)
perl(Bio::Root::Build)
perl(Bio::Root::Exception)
perl(Bio::Root::HTTPget)
perl(Bio::Root::IO)
perl(Bio::Root::Root)
perl(Bio::Root::RootI)
perl(Bio::Root::Storable)
perl(Bio::Root::Test)
perl(Bio::Root::Utilities)
perl(Bio::Root::Version)
perl(Bio::Search::BlastStatistics)
perl(Bio::Search::BlastUtils)
perl(Bio::Search::DatabaseI)
perl(Bio::SearchDist)
perl(Bio::Search::GenericDatabase)
perl(Bio::Search::GenericStatistics)
perl(Bio::Search::Hit::BlastHit)
perl(Bio::Search::Hit::BlastPullHit)
perl(Bio::Search::Hit::Fasta)
perl(Bio::Search::Hit::GenericHit)
perl(Bio::Search::Hit::HitFactory)
perl(Bio::Search::Hit::HitI)
perl(Bio::Search::Hit::hmmer3Hit)
perl(Bio::Search::Hit::HMMERHit)
perl(Bio::Search::Hit::HmmpfamHit)
perl(Bio::Search::Hit::ModelHit)
perl(Bio::Search::Hit::PsiBlastHit)
perl(Bio::Search::Hit::PullHitI)
perl(Bio::Search::HSP::BlastHSP)
perl(Bio::Search::HSP::BlastPullHSP)
perl(Bio::Search::HSP::FastaHSP)
perl(Bio::Search::HSP::GenericHSP)
perl(Bio::Search::HSP::HMMERHSP)
perl(Bio::Search::HSP::HmmpfamHSP)
perl(Bio::Search::HSP::HSPFactory)
perl(Bio::Search::HSP::HSPI)
perl(Bio::Search::HSP::ModelHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PsiBlastHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PSLHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PullHSPI)
perl(Bio::Search::HSP::WABAHSP)
perl(Bio::SearchIO)
perl(Bio::SearchIO::axt)
perl(Bio::SearchIO::blast)
perl(Bio::SearchIO::blast_pull)
perl(Bio::SearchIO::blasttable)
perl(Bio::SearchIO::blastxml)
perl(Bio::SearchIO::cross_match)
perl(Bio::SearchIO::erpin)
perl(Bio::SearchIO::EventHandlerI)
perl(Bio::SearchIO::exonerate)
perl(Bio::SearchIO::fasta)
perl(Bio::SearchIO::FastHitEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::gmap_f9)
perl(Bio::SearchIO::hmmer)
perl(Bio::SearchIO::hmmer2)
perl(Bio::SearchIO::hmmer3)
perl(Bio::SearchIO::hmmer_pull)
perl(Bio::SearchIO::infernal)
perl(Bio::SearchIO::IteratedSearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::megablast)
perl(Bio::SearchIO::psl)
perl(Bio::SearchIO::rnamotif)
perl(Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchWriterI)
perl(Bio::SearchIO::sim4)
perl(Bio::SearchIO::waba)
perl(Bio::SearchIO::wise)
perl(Bio::SearchIO::Writer::BSMLResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::GbrowseGFF)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HitTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HSPTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HTMLResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::ResultTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::TextResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::XML::BlastHandler)
perl(Bio::SearchIO::XML::PsiBlastHandler)
perl(Bio::Search::Iteration::GenericIteration)
perl(Bio::Search::Iteration::IterationI)
perl(Bio::Search::Processor)
perl(Bio::Search::Result::BlastPullResult)
perl(Bio::Search::Result::BlastResult)
perl(Bio::Search::Result::CrossMatchResult)
perl(Bio::Search::Result::GenericResult)
perl(Bio::Search::Result::hmmer3Result)
perl(Bio::Search::Result::HMMERResult)
perl(Bio::Search::Result::HmmpfamResult)
perl(Bio::Search::Result::PullResultI)
perl(Bio::Search::Result::ResultFactory)
perl(Bio::Search::Result::ResultI)
perl(Bio::Search::Result::WABAResult)
perl(Bio::Search::SearchUtils)
perl(Bio::Search::StatisticsI)
perl(Bio::Search::Tiling::MapTileUtils)
perl(Bio::Search::Tiling::MapTiling)
perl(Bio::Search::Tiling::TilingI)
perl(Bio::Seq)
perl(Bio::SeqAnalysisParserI)
perl(Bio::Seq::BaseSeqProcessor)
perl(Bio::Seq::EncodedSeq)
perl(Bio::SeqEvolution::DNAPoint)
perl(Bio::SeqEvolution::EvolutionI)
perl(Bio::SeqEvolution::Factory)
perl(Bio::SeqFeature::Amplicon)
perl(Bio::SeqFeature::AnnotationAdaptor)
perl(Bio::SeqFeature::Collection)
perl(Bio::SeqFeature::CollectionI)
perl(Bio::SeqFeature::Computation)
perl(Bio::SeqFeature::FeaturePair)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Exon)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::ExonI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructureI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Intron)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::NC_Feature)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Poly_A_site)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Promoter)
perl(Bio::SeqFeature::Generic)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Transcript)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::TranscriptI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::UTR)
perl(Bio::SeqFeatureI)
perl(Bio::SeqFeature::Lite)
perl(Bio::SeqFeature::PositionProxy)
perl(Bio::SeqFeature::Primer)
perl(Bio::SeqFeature::Similarity)
perl(Bio::SeqFeature::SimilarityPair)
perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Oligo)
perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Pair)
perl(Bio::SeqFeature::SubSeq)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::FeatureNamer)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::IDHandler)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::TypeMapper)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::Unflattener)
perl(Bio::SeqFeature::TypedSeqFeatureI)
perl(Bio::SeqI)
perl(Bio::SeqIO)
perl(Bio::SeqIO::abi)
perl(Bio::SeqIO::ace)
perl(Bio::SeqIO::agave)
perl(Bio::SeqIO::alf)
perl(Bio::SeqIO::asciitree)
perl(Bio::SeqIO::bsml)
perl(Bio::SeqIO::bsml_sax)
perl(Bio::SeqIO::chadoxml)
perl(Bio::SeqIO::chaos)
perl(Bio::SeqIO::chaosxml)
perl(Bio::SeqIO::ctf)
perl(Bio::SeqIO::embl)
perl(Bio::SeqIO::embldriver)
perl(Bio::SeqIO::entrezgene)
perl(Bio::SeqIO::excel)
perl(Bio::SeqIO::exp)
perl(Bio::SeqIO::fasta)
perl(Bio::SeqIO::fastq)
perl(Bio::SeqIO::flybase_chadoxml)
perl(Bio::SeqIO::FTHelper)
perl(Bio::SeqIO::game)
perl(Bio::SeqIO::game::featHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameSubs)
perl(Bio::SeqIO::game::gameWriter)
perl(Bio::SeqIO::game::seqHandler)
perl(Bio::SeqIO::gbdriver)
perl(Bio::SeqIO::gbxml)
perl(Bio::SeqIO::gcg)
perl(Bio::SeqIO::genbank)
perl(Bio::SeqIO::Handler::GenericRichSeqHandler)
perl(Bio::SeqIO::interpro)
perl(Bio::SeqIO::kegg)
perl(Bio::SeqIO::largefasta)
perl(Bio::SeqIO::lasergene)
perl(Bio::SeqIO::locuslink)
perl(Bio::SeqIO::mbsout)
perl(Bio::SeqIO::metafasta)
perl(Bio::SeqIO::msout)
perl(Bio::SeqIO::MultiFile)
perl(Bio::SeqIO::nexml)
perl(Bio::SeqIO::phd)
perl(Bio::SeqIO::pir)
perl(Bio::SeqIO::pln)
perl(Bio::SeqIO::qual)
perl(Bio::SeqIO::raw)
perl(Bio::SeqIO::scf)
perl(Bio::SeqIO::seqxml)
perl(Bio::SeqIO::strider)
perl(Bio::SeqIO::swiss)
perl(Bio::SeqIO::swissdriver)
perl(Bio::SeqIO::tab)
perl(Bio::SeqIO::table)
perl(Bio::SeqIO::tigr)
perl(Bio::SeqIO::tigrxml)
perl(Bio::SeqIO::tinyseq)
perl(Bio::SeqIO::tinyseq::tinyseqHandler)
perl(Bio::SeqIO::ztr)
perl(Bio::Seq::LargeLocatableSeq)
perl(Bio::Seq::LargePrimarySeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeqI)
perl(Bio::Seq::Meta)
perl(Bio::Seq::Meta::Array)
perl(Bio::Seq::MetaI)
perl(Bio::Seq::PrimaryQual)
perl(Bio::Seq::PrimaryQual::Qual)
perl(Bio::Seq::PrimedSeq)
perl(Bio::Seq::QualI)
perl(Bio::Seq::Quality)
perl(Bio::Seq::RichSeq)
perl(Bio::Seq::RichSeqI)
perl(Bio::Seq::SeqBuilder)
perl(Bio::Seq::SeqFactory)
perl(Bio::Seq::SeqFastaSpeedFactory)
perl(Bio::Seq::SequenceTrace)
perl(Bio::Seq::SeqWithQuality)
perl(Bio::Seq::SimulatedRead)
perl(Bio::Seq::TraceI)
perl(Bio::SeqUtils)
perl(Bio::SimpleAlign)
perl(Bio::SimpleAnalysisI)
perl(Bio::Species)
perl(Bio::Structure::Atom)
perl(Bio::Structure::Chain)
perl(Bio::Structure::Entry)
perl(Bio::Structure::IO)
perl(Bio::Structure::IO::pdb)
perl(Bio::Structure::Model)
perl(Bio::Structure::Residue)
perl(Bio::Structure::SecStr::DSSP::Res)
perl(Bio::Structure::SecStr::STRIDE::Res)
perl(Bio::Structure::StructureI)
perl(Bio::Symbol::Alphabet)
perl(Bio::Symbol::AlphabetI)
perl(Bio::Symbol::DNAAlphabet)
perl(Bio::Symbol::ProteinAlphabet)
perl(Bio::Symbol::Symbol)
perl(Bio::Symbol::SymbolI)
perl(Bio::Taxon)
perl(Bio::Taxonomy)
perl(Bio::Taxonomy::FactoryI)
perl(Bio::Taxonomy::Node)
perl(Bio::Taxonomy::Taxon)
perl(Bio::Taxonomy::Tree)
perl(Bio::Tools::AlignFactory)
perl(Bio::Tools::Alignment::Consed)
perl(Bio::Tools::Alignment::Trim)
perl(Bio::Tools::AmpliconSearch)
perl(Bio::Tools::Analysis::DNA::ESEfinder)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::Domcut)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::ELM)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::GOR4)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::HNN)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::Mitoprot)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::NetPhos)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::Scansite)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::Sopma)
perl(Bio::Tools::AnalysisResult)
perl(Bio::Tools::Analysis::SimpleAnalysisBase)
perl(Bio::Tools::Blat)
perl(Bio::Tools::CodonTable)
perl(Bio::Tools::Coil)
perl(Bio::Tools::dpAlign)
perl(Bio::Tools::ECnumber)
perl(Bio::Tools::EMBOSS::Palindrome)
perl(Bio::Tools::EPCR)
perl(Bio::Tools::Eponine)
perl(Bio::Tools::ERPIN)
perl(Bio::Tools::Est2Genome)
perl(Bio::Tools::ESTScan)
perl(Bio::Tools::Fgenesh)
perl(Bio::Tools::FootPrinter)
perl(Bio::Tools::Gel)
perl(Bio::Tools::Geneid)
perl(Bio::Tools::Genemark)
perl(Bio::Tools::Genewise)
perl(Bio::Tools::Genomewise)
perl(Bio::Tools::Genscan)
perl(Bio::Tools::GFF)
perl(Bio::Tools::Glimmer)
perl(Bio::Tools::Grail)
perl(Bio::Tools::GuessSeqFormat)
perl(Bio::Tools::HMMER::Domain)
perl(Bio::Tools::HMMER::Results)
perl(Bio::Tools::HMMER::Set)
perl(Bio::Tools::Hmmpfam)
perl(Bio::Tools::Infernal)
perl(Bio::Tools::ipcress)
perl(Bio::Tools::isPcr)
perl(Bio::Tools::IUPAC)
perl(Bio::Tools::Lucy)
perl(Bio::Tools::Match)
perl(Bio::Tools::MZEF)
perl(Bio::Tools::OddCodes)
perl(Bio::Tools::Phylo::Gerp)
perl(Bio::Tools::Phylo::Gumby)
perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy)
perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy::Result)
perl(Bio::Tools::Phylo::PAML)
perl(Bio::Tools::Phylo::PAML::Codeml)
perl(Bio::Tools::Phylo::PAML::ModelResult)
perl(Bio::Tools::Phylo::PAML::Result)
perl(Bio::Tools::Phylo::Phylip::ProtDist)
perl(Bio::Tools::pICalculator)
perl(Bio::Tools::Prediction::Exon)
perl(Bio::Tools::Prediction::Gene)
perl(Bio::Tools::Primer3)
perl(Bio::Tools::Primer::Assessor::Base)
perl(Bio::Tools::Primer::AssessorI)
perl(Bio::Tools::Primer::Feature)
perl(Bio::Tools::Primer::Pair)
perl(Bio::Tools::Prints)
perl(Bio::Tools::Profile)
perl(Bio::Tools::Promoterwise)
perl(Bio::Tools::PrositeScan)
perl(Bio::Tools::Protparam)
perl(Bio::Tools::Pseudowise)
perl(Bio::Tools::pSW)
perl(Bio::Tools::QRNA)
perl(Bio::Tools::RandomDistFunctions)
perl(Bio::Tools::RepeatMasker)
perl(Bio::Tools::RNAMotif)
perl(Bio::Tools::Run::GenericParameters)
perl(Bio::Tools::Run::ParametersI)
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perl(Bio::Tools::Run::StandAloneNCBIBlast)
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perl(Bio::Tools::Run::WrapperBase)
perl(Bio::Tools::Seg)
perl(Bio::Tools::SeqPattern)
perl(Bio::Tools::SeqPattern::Backtranslate)
perl(Bio::Tools::SeqStats)
perl(Bio::Tools::SeqWords)
perl(Bio::Tools::Sigcleave)
perl(Bio::Tools::Signalp)
perl(Bio::Tools::Signalp::ExtendedSignalp)
perl(Bio::Tools::Sim4::Exon)
perl(Bio::Tools::Sim4::Results)
perl(Bio::Tools::SiRNA)
perl(Bio::Tools::SiRNA::Ruleset::saigo)
perl(Bio::Tools::SiRNA::Ruleset::tuschl)
perl(Bio::Tools::Spidey::Exon)
perl(Bio::Tools::Spidey::Results)
perl(Bio::Tools::TandemRepeatsFinder)
perl(Bio::Tools::TargetP)
perl(Bio::Tools::Tmhmm)
perl(Bio::Tools::tRNAscanSE)
perl(Bio::Tree::AlleleNode)
perl(Bio::Tree::AnnotatableNode)
perl(Bio::Tree::Compatible)
perl(Bio::Tree::DistanceFactory)
perl(Bio::Tree::Draw::Cladogram)
perl(Bio::TreeIO)
perl(Bio::TreeIO::cluster)
perl(Bio::TreeIO::lintree)
perl(Bio::TreeIO::newick)
perl(Bio::TreeIO::NewickParser)
perl(Bio::TreeIO::nexml)
perl(Bio::TreeIO::nexus)
perl(Bio::TreeIO::nhx)
perl(Bio::TreeIO::pag)
perl(Bio::TreeIO::phyloxml)
perl(Bio::TreeIO::svggraph)
perl(Bio::TreeIO::tabtree)
perl(Bio::TreeIO::TreeEventBuilder)
perl(Bio::Tree::Node)
perl(Bio::Tree::NodeI)
perl(Bio::Tree::NodeNHX)
perl(Bio::Tree::RandomFactory)
perl(Bio::Tree::Statistics)
perl(Bio::Tree::Tree)
perl(Bio::Tree::TreeFunctionsI)
perl(Bio::Tree::TreeI)
perl(Bio::UpdateableSeqI)
perl(Bio::Variation::AAChange)
perl(Bio::Variation::AAReverseMutate)
perl(Bio::Variation::Allele)
perl(Bio::Variation::DNAMutation)
perl(Bio::Variation::IO)
perl(Bio::Variation::IO::flat)
perl(Bio::Variation::IO::xml)
perl(Bio::Variation::RNAChange)
perl(Bio::Variation::SeqDiff)
perl(Bio::Variation::SNP)
perl(Bio::Variation::VariantI)
perl(Bio::WebAgent)
perl(FeatureStore)
perl(TestInterface)
perl(TestObject)
perl-BioPerl

Requires :
rpmlib(PayloadIsXz) <= 5.2-1
rpmlib(CompressedFileNames) <= 3.0.4-1
rpmlib(PayloadFilesHavePrefix) <= 4.0-1
rpmlib(VersionedDependencies) <= 3.0.3-1
perl-base => 5.22.3


Content of RPM :
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/Align
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/Align/AlignI.pm
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/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/Handler/GenericAlignHandler.pm
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/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/bl2seq.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/clustalw.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/emboss.pm
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/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/mase.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/mega.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/meme.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/metafasta.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/msf.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/nexml.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/nexus.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/pfam.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/phylip.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.22.3/Bio/AlignIO/po.pm
There is 1807 files more in these RPM.

 
ICM