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perl-bioperl-run rpm build for : Fedora 7. For other distributions click perl-bioperl-run.

Name : perl-bioperl-run
Version : 1.5.2_100 Vendor : Fedora Project
Release : 2.fc7 Date : 2007-04-19 23:59:31
Group : Development/Libraries Source RPM : perl-bioperl-run-1.5.2_100-2.fc7.src.rpm
Size : 5.68 MB
Packager : Fedora Project < http://bugzilla_redhat_com/bugzilla>
Summary : Modules to provide a Perl interface to various bioinformatics applications
Description :
Bioperl-run contain modules that provide a Perl interface to various
bioinformatics applications. This allows various applications to be
used with common Bioperl objects.

RPM found in directory: /packages/linux-pbone/archive.fedoraproject.org/fedora/linux/releases/7/Everything/i386/os/Fedora

Content of RPM  Changelog  Provides Requires

Download
ftp.icm.edu.pl  perl-bioperl-run-1.5.2_100-2.fc7.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-bioperl-run-1.5.2_100-2.fc7.noarch.rpm
     

Provides :
perl(Bio::Factory::EMBOSS)
perl(Bio::Installer::Clustalw)
perl(Bio::Installer::EMBOSS)
perl(Bio::Installer::Generic)
perl(Bio::Installer::Muscle)
perl(Bio::Installer::PAML)
perl(Bio::Installer::Probcons)
perl(Bio::Installer::TCoffee)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Amap)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Blat)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::DBA)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Exonerate)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Kalign)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Lagan)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::MAFFT)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Muscle)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Probalign)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Probcons)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Sim4)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::StandAloneFasta)
perl(Bio::Tools::Run::Alignment::TCoffee)
perl(Bio::Tools::Run::Analysis)
perl(Bio::Tools::Run::Analysis::Job)
perl(Bio::Tools::Run::Analysis::Job::soap)
perl(Bio::Tools::Run::Analysis::Utils)
perl(Bio::Tools::Run::Analysis::soap)
perl(Bio::Tools::Run::AnalysisFactory)
perl(Bio::Tools::Run::AnalysisFactory::Pise)
perl(Bio::Tools::Run::AnalysisFactory::soap)
perl(Bio::Tools::Run::Cap3)
perl(Bio::Tools::Run::Coil)
perl(Bio::Tools::Run::EMBOSSApplication)
perl(Bio::Tools::Run::EMBOSSacd)
perl(Bio::Tools::Run::Eponine)
perl(Bio::Tools::Run::FootPrinter)
perl(Bio::Tools::Run::Genewise)
perl(Bio::Tools::Run::Genscan)
perl(Bio::Tools::Run::Hmmer)
perl(Bio::Tools::Run::Mdust)
perl(Bio::Tools::Run::Phrap)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::LVB)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Molphy::ProtML)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::PAML::Baseml)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::PAML::Codeml)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::PAML::Evolver)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::PAML::Yn00)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::Base)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::Consense)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::DrawGram)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::DrawTree)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::Neighbor)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::PhylipConf)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::ProtDist)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::ProtPars)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::SeqBoot)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::CSR)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::Puzzle)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::abiview)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::addquart)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::align2model)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::alistat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::antigenic)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::assp)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::backtranseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::bambe)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::banana)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::bionj)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::biosed)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::bl2seq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::blast2)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::blimps)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::blimps_block)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::blimps_matrix)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::boxshade)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::btwisted)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::cai)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::cap)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::cds)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::chaos)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::charge)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::checktrans)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::chips)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::cirdna)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::clique)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::clustalw)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::clustalw_convert)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::codcmp)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::coderet)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::codnocod)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::codontree)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::codonw)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::comalign)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::combat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::compseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::con_filter)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::confmat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::cons)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::consense)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::consensus)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::cpgplot)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::cpgreport)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::cusp)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::cutseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dan)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dca)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::decorate)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::degapseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::descseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dialign2)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::diffseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::digest)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::distmat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::distquart)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dnadist)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dnapars)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dollop)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::domainer)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dotmatcher)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dotpath)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dottup)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::drawgram)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::drawpyr)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::drawtree)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dreg)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::druid)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dsc)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::dssp)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::einverted)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::emma)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::emowse)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::environ)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::eprimer3)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::equicktandem)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::est2genome)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::etandem)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::extractfeat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::extractseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::fasta)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::fastdnaml)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::fastrna)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::filtersites)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::findkm)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::fitch)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::fmtseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::freak)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::fuzznuc)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::fuzzpro)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::fuzztran)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::gb2xml)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::geecee)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::genscan)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::getblock)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::getorf)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::gff2ps)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::gibbs)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::gibbs_scan)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::golden)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::grailclnt)
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perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::helixturnhelix)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmalign)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmbuild)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmcalibrate)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmconvert)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmemit)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmer2sam)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmfetch)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmpfam)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmscore)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmmsearch)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::hmoment)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::homology)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::html4blast)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::iep)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::infoalign)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::infoseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::interface)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::isochore)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::kitsch)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::lassap)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::lindna)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::listor)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::loadseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::lvb)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::makehist)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::map)
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perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::maskseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::matcher)
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perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::melting)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::merger)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::mfold)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::mix)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::modelfromalign)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::most)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::mreps)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::msa)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::msbar)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::mspcrunch)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::mview_alig)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::mview_blast)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::mwfilter)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::needle)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::neighbor)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::newcpgreport)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::newcpgseek)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::newseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::njdist)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::nnssp)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::notseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::nrscope)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::nthseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::octanol)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::oddcomp)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::palindrome)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pam)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::parciquart)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pars)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pasteseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::patmatdb)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::patmatmotifs)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::patser)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pdbsearch)
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perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pepinfo)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pepnet)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pepstats)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pepwheel)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pepwindow)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pepwindowall)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pestfind)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pftools)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::phiblast)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::phyml)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pima)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::plotcon)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::plotorf)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::plsearch)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::polydot)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pratt)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::predator)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::preg)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::prettyalign)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::prettyplot)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::prettyseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::primersearch)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::primo)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::prodom)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::profit)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::prophecy)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::prophet)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::prose)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::prot_nucml)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::protal2dna)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::protdist)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::protpars)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pscan)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::psiblast)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::psort2)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pyramids)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::pyreval)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::qstar)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::quicktree)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::readnexus)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::readseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::recoder)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::redata)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::remap)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::repeats)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::restover)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::restrict)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::revseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::rnadistance)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::rnaeval)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::rnafold)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::rnaga)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::rnaheat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::rnainverse)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::rnapdist)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::rnasubopt)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::sam2hmmer)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::sampleseqs)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::saps)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::satellites)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::scan_for_matches)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::scope)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::scopparse)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::seqboot)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::seqgen)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::seqmatchall)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::seqsblast)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::seqstat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::showalign)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::showfeat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::showorf)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::showseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::shuffleseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::sigcleave)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::siggen)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::sigscan)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::silent)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::sirna)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::splitter)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::sreformat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::stretcher)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::stride)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::stssearch)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::supermatcher)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::syco)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::tacg)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::tfscan)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::tipdate)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::tmap)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::toppred)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::tranalign)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::transeq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::treealign)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::trimest)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::trimseq)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::trnascan)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::twofeat)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::unroot)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::vectorstrip)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::water)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::weighbor)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::whichdb)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::wise2)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::wobble)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::wordcount)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::wordmatch)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::wublast2)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::xblast)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::xpound)
perl(Bio::Tools::Run::PiseJob)
perl(Bio::Tools::Run::PiseJobParser)
perl(Bio::Tools::Run::PiseWorkflow)
perl(Bio::Tools::Run::Primate)
perl(Bio::Tools::Run::Primer3)
perl(Bio::Tools::Run::Prints)
perl(Bio::Tools::Run::Profile)
perl(Bio::Tools::Run::Promoterwise)
perl(Bio::Tools::Run::Pseudowise)
perl(Bio::Tools::Run::RepeatMasker)
perl(Bio::Tools::Run::Seg)
perl(Bio::Tools::Run::Signalp)
perl(Bio::Tools::Run::Tmhmm)
perl(Bio::Tools::Run::TribeMCL)
perl(Bio::Tools::Run::Vista)
perl-bioperl-run

Requires :
perl(Getopt::Long)
perl(Bio::Factory::ApplicationFactoryI)
perl(Bio::Tools::Prints)
perl(Bio::Factory::ObjectFactory)
perl(POSIX)
perl(File::Spec)
perl(Exporter)
perl(Config)
perl(CGI)
perl(Bio::Tools::Genscan)
perl(Bio::Tools::AnalysisResult)
perl(Bio::Tools::Run::EMBOSSApplication)
perl(ExtUtils::MakeMaker)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Exon)
perl(Bio::Search::HSP::GenericHSP)
perl(Bio::Species)
perl(Bio::Installer::Generic)
perl(LWP::UserAgent)
perl(Bio::Seq)
perl(Bio::Matrix::PhylipDist)
perl(LWP)
perl(Bio::Tools::Run::EMBOSSacd)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::ProtDist)
perl(Bio::Tools::FootPrinter)
perl(Bio::Root::Version)
perl(Bio::Tools::RepeatMasker)
perl(Bio::AnalysisI)
perl(Bio::Tools::Coil)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Transcript)
perl(Bio::Cluster::SequenceFamily)
perl(Fcntl)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::Base)
perl(Bio::Tools::Phylo::PAML)
perl(File::Temp)
perl(Bio::Annotation::DBLink)
perl(Bio::Root::Root)
perl(Bio::Tools::Eponine)
perl(Bio::Tools::Phylo::Phylip::ProtDist)
rpmlib(CompressedFileNames) <= 3.0.4-1
perl(Bio::Tools::Pseudowise)
perl(:MODULE_COMPAT_5.8.8)
perl(IO::String)
perl(Bio::Tools::Tmhmm)
perl(File::Copy)
perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication)
perl(base)
perl(Bio::TreeIO)
perl(Bio::Tools::Run::Analysis)
perl(Bio::SeqFeature::FeaturePair)
perl(HTTP::Request::Common)
perl(Bio::Root::IO)
perl(Bio::Tools::Profile)
perl(Bio::Tools::Sim4::Results)
perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy)
perl(Bio::SeqIO)
perl(vars)
perl(Bio::Tools::Run::WrapperBase)
perl(Bio::Tools::Primer3)
perl(Bio::Tools::Run::PiseJob)
perl(Bio::Assembly::IO)
/usr/bin/perl
perl(Bio::Tools::Signalp)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::PhylipConf)
perl(Bio::SeqFeature::Generic)
perl(Bio::Tools::Run::AnalysisFactory)
perl(Data::Dumper)
perl(Bio::AlignIO)
perl => 0:5.005_62
perl(Bio::AlignIO::fasta)
perl(Bio::Tools::Promoterwise)
perl(Bio::Factory::AnalysisI)
perl(Bio::Tools::Seg)
perl(Bio::SearchIO)
perl(Getopt::Std)
perl(Bio::SimpleAlign)
perl(Bio::Tools::Run::PiseJobParser)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::Neighbor)
perl(XML::Parser::PerlSAX)
rpmlib(PayloadFilesHavePrefix) <= 4.0-1
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure)
perl(Cwd)
perl(Bio::Tools::Genewise)
perl(strict)


Content of RPM :
/usr/bin/bp_bioperl_application_installer.pl
/usr/bin/bp_multi_hmmsearch.pl
/usr/bin/bp_panalysis.pl
/usr/bin/bp_papplmaker.pl
/usr/bin/bp_run_neighbor.pl
/usr/bin/bp_run_protdist.pl
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Factory
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Factory/EMBOSS.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Installer
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Installer/Clustalw.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Installer/EMBOSS.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Installer/Generic.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Installer/Muscle.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Installer/PAML.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Installer/Probcons.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Installer/TCoffee.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/Amap.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/Blat.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/Clustalw.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/DBA.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/Exonerate.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/Kalign.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/Lagan.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/MAFFT.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/Muscle.pm
/usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8/Bio/Tools/Run/Alignment/Probalign.pm
There is 713 files more in these RPM.

  
ICM