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perl-Bioperl rpm build for : Mandriva 2006. For other distributions click perl-Bioperl.

Name : perl-Bioperl
Version : 1.5.0 Vendor : Mandriva
Release : 2mdk Date : 2005-06-06 12:58:25
Group : Development/Perl Source RPM : perl-Bioperl-1.5.0-2mdk.src.rpm
Size : 15.67 MB
Packager : Nicolas L�cureuil < neoclust_mandriva_org>
Summary : BioPerl core modules
Description :
Officially organized in 1995 and existing informally for several years
prior, The Bioperl Project is an international association of developers
of open source Perl tools for bioinformatics, genomics and life science
research.

RPM found in directory: /vol/rzm6/linux-mandriva/devel/2006.0/i586/media/contrib

Content of RPM  Changelog  Provides Requires

Download
ftp.icm.edu.pl  perl-Bioperl-1.5.0-2mdk.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-Bioperl-1.5.0-2mdk.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-Bioperl-1.5.0-2mdk.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-Bioperl-1.5.0-2mdk.noarch.rpm
     

Provides :
perl(Bio::Align::AlignI)
perl(Bio::Align::DNAStatistics)
perl(Bio::Align::PairwiseStatistics)
perl(Bio::Align::ProteinStatistics)
perl(Bio::Align::StatisticsI)
perl(Bio::Align::Utilities)
perl(Bio::AlignIO)
perl(Bio::AlignIO::bl2seq)
perl(Bio::AlignIO::clustalw)
perl(Bio::AlignIO::emboss)
perl(Bio::AlignIO::fasta)
perl(Bio::AlignIO::largemultifasta)
perl(Bio::AlignIO::maf)
perl(Bio::AlignIO::mase)
perl(Bio::AlignIO::mega)
perl(Bio::AlignIO::meme)
perl(Bio::AlignIO::metafasta)
perl(Bio::AlignIO::msf)
perl(Bio::AlignIO::nexus)
perl(Bio::AlignIO::pfam)
perl(Bio::AlignIO::phylip)
perl(Bio::AlignIO::po)
perl(Bio::AlignIO::prodom)
perl(Bio::AlignIO::psi)
perl(Bio::AlignIO::selex)
perl(Bio::AlignIO::stockholm)
perl(Bio::AnalysisI)
perl(Bio::AnalysisI::JobI)
perl(Bio::AnalysisParserI)
perl(Bio::AnalysisResultI)
perl(Bio::AnnotatableI)
perl(Bio::Annotation::AnnotationFactory)
perl(Bio::Annotation::Collection)
perl(Bio::Annotation::Comment)
perl(Bio::Annotation::DBLink)
perl(Bio::Annotation::OntologyTerm)
perl(Bio::Annotation::Reference)
perl(Bio::Annotation::SimpleValue)
perl(Bio::Annotation::StructuredValue)
perl(Bio::Annotation::Target)
perl(Bio::Annotation::TypeManager)
perl(Bio::AnnotationCollectionI)
perl(Bio::AnnotationI)
perl(Bio::Assembly::Contig)
perl(Bio::Assembly::ContigAnalysis)
perl(Bio::Assembly::IO)
perl(Bio::Assembly::IO::ace)
perl(Bio::Assembly::IO::phrap)
perl(Bio::Assembly::Scaffold)
perl(Bio::Assembly::ScaffoldI)
perl(Bio::Assembly::Singlet)
perl(Bio::Biblio)
perl(Bio::Biblio::Article)
perl(Bio::Biblio::BiblioBase)
perl(Bio::Biblio::Book)
perl(Bio::Biblio::BookArticle)
perl(Bio::Biblio::IO)
perl(Bio::Biblio::IO::medline2ref)
perl(Bio::Biblio::IO::medlinexml)
perl(Bio::Biblio::IO::pubmed2ref)
perl(Bio::Biblio::IO::pubmedxml)
perl(Bio::Biblio::Journal)
perl(Bio::Biblio::JournalArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineBook)
perl(Bio::Biblio::MedlineBookArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineJournal)
perl(Bio::Biblio::MedlineJournalArticle)
perl(Bio::Biblio::Organisation)
perl(Bio::Biblio::Patent)
perl(Bio::Biblio::Person)
perl(Bio::Biblio::Proceeding)
perl(Bio::Biblio::Provider)
perl(Bio::Biblio::PubmedArticle)
perl(Bio::Biblio::PubmedBookArticle)
perl(Bio::Biblio::PubmedJournalArticle)
perl(Bio::Biblio::Ref)
perl(Bio::Biblio::Service)
perl(Bio::Biblio::TechReport)
perl(Bio::Biblio::Thesis)
perl(Bio::Biblio::WebResource)
perl(Bio::Cluster::ClusterFactory)
perl(Bio::Cluster::FamilyI)
perl(Bio::Cluster::SequenceFamily)
perl(Bio::Cluster::UniGene)
perl(Bio::Cluster::UniGeneI)
perl(Bio::ClusterI)
perl(Bio::ClusterIO)
perl(Bio::ClusterIO::dbsnp)
perl(Bio::ClusterIO::unigene)
perl(Bio::CodonUsage::IO)
perl(Bio::CodonUsage::Table)
perl(Bio::Coordinate::Chain)
perl(Bio::Coordinate::Collection)
perl(Bio::Coordinate::ExtrapolatingPair)
perl(Bio::Coordinate::GeneMapper)
perl(Bio::Coordinate::Graph)
perl(Bio::Coordinate::MapperI)
perl(Bio::Coordinate::Pair)
perl(Bio::Coordinate::Result)
perl(Bio::Coordinate::Result::Gap)
perl(Bio::Coordinate::Result::Match)
perl(Bio::Coordinate::ResultI)
perl(Bio::Coordinate::Utils)
perl(Bio::DB::Ace)
perl(Bio::DB::Biblio::biofetch)
perl(Bio::DB::Biblio::eutils)
perl(Bio::DB::Biblio::soap)
perl(Bio::DB::BiblioI)
perl(Bio::DB::BioFetch)
perl(Bio::DB::CUTG)
perl(Bio::DB::DBFetch)
perl(Bio::DB::EMBL)
perl(Bio::DB::Failover)
perl(Bio::DB::Fasta)
perl(Bio::DB::Fasta::Stream)
perl(Bio::DB::FileCache)
perl(Bio::DB::Flat)
perl(Bio::DB::Flat::BDB)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::embl)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::fasta)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::genbank)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::swiss)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::swissprot)
perl(Bio::DB::Flat::BinarySearch)
perl(Bio::DB::GDB)
perl(Bio::DB::GFF)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::ace)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch_oracle)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch_to_stdout)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::caching_handle)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::faux_dbh)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::iterator)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysql)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlace)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlopt)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::oracle)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::oracleace)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::pg)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::faux)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::memory)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::memory_iterator)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::alignment)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::clone)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::coding)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::match)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::none)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::processed_transcript)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::transcript)
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perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_ensgene)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_genscan)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_refgene)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_sanger22)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_sanger22pseudo)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_softberry)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_twinscan)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_unigene)
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perl(Bio::DB::GFF::Feature)
perl(Bio::DB::GFF::Homol)
perl(Bio::DB::GFF::ID_Iterator)
perl(Bio::DB::GFF::RelSegment)
perl(Bio::DB::GFF::Segment)
perl(Bio::DB::GFF::Typename)
perl(Bio::DB::GFF::Util::Binning)
perl(Bio::DB::GFF::Util::Rearrange)
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perl(Bio::DB::GenPept)
perl(Bio::DB::InMemoryCache)
perl(Bio::DB::MeSH)
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perl(Bio::DB::Query::GenBank)
perl(Bio::DB::Query::WebQuery)
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perl(Bio::DB::RandomAccessI)
perl(Bio::DB::RefSeq)
perl(Bio::DB::Registry)
perl(Bio::DB::SeqI)
perl(Bio::DB::SwissProt)
perl(Bio::DB::Taxonomy)
perl(Bio::DB::Taxonomy::entrez)
perl(Bio::DB::Taxonomy::flatfile)
perl(Bio::DB::Universal)
perl(Bio::DB::UpdateableSeqI)
perl(Bio::DB::WebDBSeqI)
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perl(Bio::DB::XEMBLService)
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perl(Bio::Das::FeatureTypeI)
perl(Bio::Das::SegmentI)
perl(Bio::DasI)
perl(Bio::DescribableI)
perl(Bio::Event::EventGeneratorI)
perl(Bio::Event::EventHandlerI)
perl(Bio::Expression::FeatureGroup)
perl(Bio::Expression::FeatureGroup::FeatureGroupMas50)
perl(Bio::Expression::FeatureI)
perl(Bio::Expression::FeatureSet::FeatureSetMas50)
perl(Bio::Factory::AnalysisI)
perl(Bio::Factory::ApplicationFactoryI)
perl(Bio::Factory::DriverFactory)
perl(Bio::Factory::FTLocationFactory)
perl(Bio::Factory::HitFactoryI)
perl(Bio::Factory::LocationFactoryI)
perl(Bio::Factory::MapFactoryI)
perl(Bio::Factory::ObjectBuilderI)
perl(Bio::Factory::ObjectFactory)
perl(Bio::Factory::ObjectFactoryI)
perl(Bio::Factory::ResultFactoryI)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactory)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceProcessorI)
perl(Bio::Factory::SequenceStreamI)
perl(Bio::Factory::TreeFactoryI)
perl(Bio::FeatureHolderI)
perl(Bio::FeatureIO)
perl(Bio::FeatureIO::bed)
perl(Bio::FeatureIO::gff)
perl(Bio::FeatureIO::gtf)
perl(Bio::FeatureIO::interpro)
perl(Bio::Graph::Edge)
perl(Bio::Graph::IO)
perl(Bio::Graph::IO::dip)
perl(Bio::Graph::IO::psi_xml)
perl(Bio::Graph::ProteinGraph)
perl(Bio::Graph::SimpleGraph)
perl(Bio::Graph::SimpleGraph::Traversal)
perl(Bio::Graphics)
perl(Bio::Graphics::ConfiguratorI)
perl(Bio::Graphics::Feature)
perl(Bio::Graphics::FeatureFile)
perl(Bio::Graphics::FeatureFile::Iterator)
perl(Bio::Graphics::Glyph)
perl(Bio::Graphics::Glyph::Factory)
perl(Bio::Graphics::Glyph::alignment)
perl(Bio::Graphics::Glyph::anchored_arrow)
perl(Bio::Graphics::Glyph::arrow)
perl(Bio::Graphics::Glyph::box)
perl(Bio::Graphics::Glyph::broken_line)
perl(Bio::Graphics::Glyph::cds)
perl(Bio::Graphics::Glyph::christmas_arrow)
perl(Bio::Graphics::Glyph::crossbox)
perl(Bio::Graphics::Glyph::dashed_line)
perl(Bio::Graphics::Glyph::diamond)
perl(Bio::Graphics::Glyph::dna)
perl(Bio::Graphics::Glyph::dot)
perl(Bio::Graphics::Glyph::dumbbell)
perl(Bio::Graphics::Glyph::ellipse)
perl(Bio::Graphics::Glyph::ex)
perl(Bio::Graphics::Glyph::extending_arrow)
perl(Bio::Graphics::Glyph::flag)
perl(Bio::Graphics::Glyph::generic)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::group)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::lightning)
perl(Bio::Graphics::Glyph::line)
perl(Bio::Graphics::Glyph::minmax)
perl(Bio::Graphics::Glyph::oval)
perl(Bio::Graphics::Glyph::pentagram)
perl(Bio::Graphics::Glyph::pinsertion)
perl(Bio::Graphics::Glyph::primers)
perl(Bio::Graphics::Glyph::processed_transcript)
perl(Bio::Graphics::Glyph::ragged_ends)
perl(Bio::Graphics::Glyph::redgreen_box)
perl(Bio::Graphics::Glyph::redgreen_segment)
perl(Bio::Graphics::Glyph::repeating_shape)
perl(Bio::Graphics::Glyph::rndrect)
perl(Bio::Graphics::Glyph::ruler_arrow)
perl(Bio::Graphics::Glyph::saw_teeth)
perl(Bio::Graphics::Glyph::segmented_keyglyph)
perl(Bio::Graphics::Glyph::segments)
perl(Bio::Graphics::Glyph::span)
perl(Bio::Graphics::Glyph::splice_site)
perl(Bio::Graphics::Glyph::text_in_box)
perl(Bio::Graphics::Glyph::three_letters)
perl(Bio::Graphics::Glyph::tic_tac_toe)
perl(Bio::Graphics::Glyph::toomany)
perl(Bio::Graphics::Glyph::track)
perl(Bio::Graphics::Glyph::transcript)
perl(Bio::Graphics::Glyph::transcript2)
perl(Bio::Graphics::Glyph::translation)
perl(Bio::Graphics::Glyph::triangle)
perl(Bio::Graphics::Glyph::two_bolts)
perl(Bio::Graphics::Glyph::wave)
perl(Bio::Graphics::Glyph::weighted_arrow)
perl(Bio::Graphics::Glyph::xyplot)
perl(Bio::Graphics::Panel)
perl(Bio::Graphics::Pictogram)
perl(Bio::Graphics::RendererI)
perl(Bio::Graphics::Util)
perl(Bio::IdCollectionI)
perl(Bio::IdentifiableI)
perl(Bio::Index::Abstract)
perl(Bio::Index::AbstractSeq)
perl(Bio::Index::Blast)
perl(Bio::Index::EMBL)
perl(Bio::Index::Fasta)
perl(Bio::Index::Fastq)
perl(Bio::Index::GenBank)
perl(Bio::Index::Hmmer)
perl(Bio::Index::Qual)
perl(Bio::Index::SwissPfam)
perl(Bio::Index::Swissprot)
perl(Bio::LiveSeq::AARange)
perl(Bio::LiveSeq::Chain)
perl(Bio::LiveSeq::ChainI)
perl(Bio::LiveSeq::DNA)
perl(Bio::LiveSeq::Exon)
perl(Bio::LiveSeq::Gene)
perl(Bio::LiveSeq::IO::BioPerl)
perl(Bio::LiveSeq::IO::Loader)
perl(Bio::LiveSeq::IO::SRS)
perl(Bio::LiveSeq::Intron)
perl(Bio::LiveSeq::Mutation)
perl(Bio::LiveSeq::Mutator)
perl(Bio::LiveSeq::Prim_Transcript)
perl(Bio::LiveSeq::Range)
perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Region)
perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Unit)
perl(Bio::LiveSeq::SeqI)
perl(Bio::LiveSeq::Transcript)
perl(Bio::LiveSeq::Translation)
perl(Bio::LocatableSeq)
perl(Bio::Location::Atomic)
perl(Bio::Location::AvWithinCoordPolicy)
perl(Bio::Location::CoordinatePolicyI)
perl(Bio::Location::Fuzzy)
perl(Bio::Location::FuzzyLocationI)
perl(Bio::Location::NarrowestCoordPolicy)
perl(Bio::Location::Simple)
perl(Bio::Location::Split)
perl(Bio::Location::SplitLocationI)
perl(Bio::Location::WidestCoordPolicy)
perl(Bio::LocationI)
perl(Bio::Map::Clone)
perl(Bio::Map::Contig)
perl(Bio::Map::CytoMap)
perl(Bio::Map::CytoMarker)
perl(Bio::Map::CytoPosition)
perl(Bio::Map::FPCMarker)
perl(Bio::Map::LinkageMap)
perl(Bio::Map::LinkagePosition)
perl(Bio::Map::MapI)
perl(Bio::Map::MappableI)
perl(Bio::Map::Marker)
perl(Bio::Map::MarkerI)
perl(Bio::Map::Microsatellite)
perl(Bio::Map::OrderedPosition)
perl(Bio::Map::OrderedPositionWithDistance)
perl(Bio::Map::Physical)
perl(Bio::Map::Position)
perl(Bio::Map::PositionI)
perl(Bio::Map::SimpleMap)
perl(Bio::MapIO)
perl(Bio::MapIO::fpc)
perl(Bio::MapIO::mapmaker)
perl(Bio::Matrix::Generic)
perl(Bio::Matrix::IO)
perl(Bio::Matrix::IO::phylip)
perl(Bio::Matrix::IO::scoring)
perl(Bio::Matrix::MatrixI)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::mast)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::masta)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::meme)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::psiblast)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::transfac)
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perl(Bio::Matrix::PSM::InstanceSiteI)
perl(Bio::Matrix::PSM::ProtMatrix)
perl(Bio::Matrix::PSM::ProtPsm)
perl(Bio::Matrix::PSM::Psm)
perl(Bio::Matrix::PSM::PsmHeader)
perl(Bio::Matrix::PSM::PsmHeaderI)
perl(Bio::Matrix::PSM::PsmI)
perl(Bio::Matrix::PSM::SiteMatrix)
perl(Bio::Matrix::PSM::SiteMatrixI)
perl(Bio::Matrix::PhylipDist)
perl(Bio::Matrix::Scoring)
perl(Bio::Ontology::DocumentRegistry)
perl(Bio::Ontology::GOterm)
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perl(Bio::Ontology::Ontology)
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perl(Bio::Ontology::OntologyI)
perl(Bio::Ontology::OntologyStore)
perl(Bio::Ontology::Path)
perl(Bio::Ontology::PathI)
perl(Bio::Ontology::Relationship)
perl(Bio::Ontology::RelationshipFactory)
perl(Bio::Ontology::RelationshipI)
perl(Bio::Ontology::RelationshipType)
perl(Bio::Ontology::SimpleGOEngine)
perl(Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine)
perl(Bio::Ontology::Term)
perl(Bio::Ontology::TermFactory)
perl(Bio::Ontology::TermI)
perl(Bio::OntologyIO)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::BaseSAXHandler)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterProHandler)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterPro_BioSQL_Handler)
perl(Bio::OntologyIO::InterProParser)
perl(Bio::OntologyIO::dagflat)
perl(Bio::OntologyIO::goflat)
perl(Bio::OntologyIO::simplehierarchy)
perl(Bio::OntologyIO::soflat)
perl(Bio::Perl)
perl(Bio::Phenotype::Correlate)
perl(Bio::Phenotype::MeSH::Term)
perl(Bio::Phenotype::MeSH::Twig)
perl(Bio::Phenotype::Measure)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::MiniMIMentry)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentry)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentryAllelicVariant)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMparser)
perl(Bio::Phenotype::Phenotype)
perl(Bio::Phenotype::PhenotypeI)
perl(Bio::PopGen::Genotype)
perl(Bio::PopGen::GenotypeI)
perl(Bio::PopGen::HtSNP)
perl(Bio::PopGen::IO)
perl(Bio::PopGen::IO::csv)
perl(Bio::PopGen::IO::hapmap)
perl(Bio::PopGen::IO::phase)
perl(Bio::PopGen::IO::prettybase)
perl(Bio::PopGen::Individual)
perl(Bio::PopGen::IndividualI)
perl(Bio::PopGen::Marker)
perl(Bio::PopGen::MarkerI)
perl(Bio::PopGen::PopStats)
perl(Bio::PopGen::Population)
perl(Bio::PopGen::PopulationI)
perl(Bio::PopGen::Simulation::Coalescent)
perl(Bio::PopGen::Simulation::GeneticDrift)
perl(Bio::PopGen::Statistics)
perl(Bio::PopGen::TagHaplotype)
perl(Bio::PopGen::Utilities)
perl(Bio::PrimarySeq)
perl(Bio::PrimarySeq::Fasta)
perl(Bio::PrimarySeqI)
perl(Bio::Range)
perl(Bio::RangeI)
perl(Bio::Restriction::Analysis)
perl(Bio::Restriction::Enzyme)
perl(Bio::Restriction::Enzyme::MultiCut)
perl(Bio::Restriction::Enzyme::MultiSite)
perl(Bio::Restriction::EnzymeCollection)
perl(Bio::Restriction::EnzymeI)
perl(Bio::Restriction::IO)
perl(Bio::Restriction::IO::bairoch)
perl(Bio::Restriction::IO::base)
perl(Bio::Restriction::IO::itype2)
perl(Bio::Restriction::IO::withrefm)
perl(Bio::Root::Err)
perl(Bio::Root::Exception)
perl(Bio::Root::Global)
perl(Bio::Root::HTTPget)
perl(Bio::Root::IO)
perl(Bio::Root::IOManager)
perl(Bio::Root::Object)
perl(Bio::Root::Root)
perl(Bio::Root::RootI)
perl(Bio::Root::Storable)
perl(Bio::Root::Utilities)
perl(Bio::Root::Vector)
perl(Bio::Root::Version)
perl(Bio::Root::Xref)
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perl(Bio::Search::BlastUtils)
perl(Bio::Search::DatabaseI)
perl(Bio::Search::GenericDatabase)
perl(Bio::Search::GenericStatistics)
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perl(Bio::Search::HSP::HSPFactory)
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perl(Bio::Search::HSP::PSLHSP)
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perl(Bio::Search::HSP::RealignHSP)
perl(Bio::Search::HSP::WABAHSP)
perl(Bio::Search::Hit::BlastHit)
perl(Bio::Search::Hit::Fasta)
perl(Bio::Search::Hit::GenericHit)
perl(Bio::Search::Hit::HMMERHit)
perl(Bio::Search::Hit::HitFactory)
perl(Bio::Search::Hit::HitI)
perl(Bio::Search::Hit::PsiBlastHit)
perl(Bio::Search::Iteration::GenericIteration)
perl(Bio::Search::Iteration::IterationI)
perl(Bio::Search::Processor)
perl(Bio::Search::Result::BlastResult)
perl(Bio::Search::Result::GenericResult)
perl(Bio::Search::Result::HMMERResult)
perl(Bio::Search::Result::ResultFactory)
perl(Bio::Search::Result::ResultI)
perl(Bio::Search::Result::WABAResult)
perl(Bio::Search::SearchUtils)
perl(Bio::Search::StatisticsI)
perl(Bio::SearchDist)
perl(Bio::SearchIO)
perl(Bio::SearchIO::EventHandlerI)
perl(Bio::SearchIO::FastHitEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::IteratedSearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder)
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perl(Bio::SearchIO::Writer::BSMLResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::GbrowseGFF)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HSPTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HTMLResultWriter)
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perl(Bio::SearchIO::Writer::ResultTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::TextResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::axt)
perl(Bio::SearchIO::blast)
perl(Bio::SearchIO::blasttable)
perl(Bio::SearchIO::blastxml)
perl(Bio::SearchIO::exonerate)
perl(Bio::SearchIO::fasta)
perl(Bio::SearchIO::hmmer)
perl(Bio::SearchIO::megablast)
perl(Bio::SearchIO::psl)
perl(Bio::SearchIO::sim4)
perl(Bio::SearchIO::waba)
perl(Bio::SearchIO::wise)
perl(Bio::Seq)
perl(Bio::Seq::BaseSeqProcessor)
perl(Bio::Seq::EncodedSeq)
perl(Bio::Seq::LargeLocatableSeq)
perl(Bio::Seq::LargePrimarySeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeqI)
perl(Bio::Seq::Meta)
perl(Bio::Seq::Meta::Array)
perl(Bio::Seq::MetaI)
perl(Bio::Seq::PrimaryQual)
perl(Bio::Seq::PrimedSeq)
perl(Bio::Seq::QualI)
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perl(Bio::Seq::RichSeqI)
perl(Bio::Seq::SeqBuilder)
perl(Bio::Seq::SeqFactory)
perl(Bio::Seq::SeqFastaSpeedFactory)
perl(Bio::Seq::SeqWithQuality)
perl(Bio::Seq::SequenceTrace)
perl(Bio::Seq::TraceI)
perl(Bio::SeqAnalysisParserI)
perl(Bio::SeqFeature::Annotated)
perl(Bio::SeqFeature::AnnotationAdaptor)
perl(Bio::SeqFeature::Collection)
perl(Bio::SeqFeature::CollectionI)
perl(Bio::SeqFeature::Computation)
perl(Bio::SeqFeature::FeaturePair)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Exon)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::ExonI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructureI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Intron)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::NC_Feature)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Poly_A_site)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Promoter)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Transcript)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::TranscriptI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::UTR)
perl(Bio::SeqFeature::Generic)
perl(Bio::SeqFeature::PositionProxy)
perl(Bio::SeqFeature::Primer)
perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Oligo)
perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Pair)
perl(Bio::SeqFeature::Similarity)
perl(Bio::SeqFeature::SimilarityPair)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::FeatureNamer)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::IDHandler)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::TypeMapper)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::Unflattener)
perl(Bio::SeqFeatureI)
perl(Bio::SeqI)
perl(Bio::SeqIO)
perl(Bio::SeqIO::FTHelper)
perl(Bio::SeqIO::MultiFile)
perl(Bio::SeqIO::abi)
perl(Bio::SeqIO::ace)
perl(Bio::SeqIO::agave)
perl(Bio::SeqIO::alf)
perl(Bio::SeqIO::asciitree)
perl(Bio::SeqIO::bsml)
perl(Bio::SeqIO::bsml_sax)
perl(Bio::SeqIO::chadoxml)
perl(Bio::SeqIO::chaos)
perl(Bio::SeqIO::chaosxml)
perl(Bio::SeqIO::ctf)
perl(Bio::SeqIO::embl)
perl(Bio::SeqIO::exp)
perl(Bio::SeqIO::fasta)
perl(Bio::SeqIO::fastq)
perl(Bio::SeqIO::game)
perl(Bio::SeqIO::game::featHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameSubs)
perl(Bio::SeqIO::game::gameWriter)
perl(Bio::SeqIO::game::seqHandler)
perl(Bio::SeqIO::gcg)
perl(Bio::SeqIO::genbank)
perl(Bio::SeqIO::interpro)
perl(Bio::SeqIO::kegg)
perl(Bio::SeqIO::largefasta)
perl(Bio::SeqIO::locuslink)
perl(Bio::SeqIO::metafasta)
perl(Bio::SeqIO::phd)
perl(Bio::SeqIO::pir)
perl(Bio::SeqIO::pln)
perl(Bio::SeqIO::qual)
perl(Bio::SeqIO::raw)
perl(Bio::SeqIO::scf)
perl(Bio::SeqIO::swiss)
perl(Bio::SeqIO::tab)
perl(Bio::SeqIO::tigr)
perl(Bio::SeqIO::tigrxml)
perl(Bio::SeqIO::tinyseq)
perl(Bio::SeqIO::tinyseq::tinyseqHandler)
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Content of RPM :
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/usr/bin/bp_local_taxonomydb_query.pl
/usr/bin/bp_mask_by_search.pl
/usr/bin/bp_meta_gff.pl
There is 2080 files more in these RPM.

 
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