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perl-bioperl rpm build for : Mandriva  2007. For other distributions click perl-bioperl.

Name : perl-bioperl
Version : 1.5.1 Vendor : Mandriva
Release : 5mdv2007.1 Date : 2007-03-13 15:18:58
Group : Development/Perl Source RPM : perl-bioperl-1.5.1-5mdv2007.1.src.rpm
Size : 21.04 MB
Packager : Pixel < pixel_mandriva_com>
Summary : BioPerl core modules
Description :
Officially organized in 1995 and existing informally for several years
prior, The Bioperl Project is an international association of developers
of open source Perl tools for bioinformatics, genomics and life science
research.

RPM found in directory: /vol/rzm6/linux-mandriva/official/2007.1/i586/media/contrib/release

Content of RPM  Changelog  Provides Requires

Download
ftp.icm.edu.pl  perl-bioperl-1.5.1-5mdv2007.1.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-bioperl-1.5.1-5mdv2007.1.noarch.rpm
     

Provides :
perl-Bioperl
perl(Bio::Align::AlignI)
perl(Bio::Align::DNAStatistics)
perl(Bio::Align::PairwiseStatistics)
perl(Bio::Align::ProteinStatistics)
perl(Bio::Align::StatisticsI)
perl(Bio::Align::Utilities)
perl(Bio::AlignIO)
perl(Bio::AlignIO::bl2seq)
perl(Bio::AlignIO::clustalw)
perl(Bio::AlignIO::emboss)
perl(Bio::AlignIO::fasta)
perl(Bio::AlignIO::largemultifasta)
perl(Bio::AlignIO::maf)
perl(Bio::AlignIO::mase)
perl(Bio::AlignIO::mega)
perl(Bio::AlignIO::meme)
perl(Bio::AlignIO::metafasta)
perl(Bio::AlignIO::msf)
perl(Bio::AlignIO::nexus)
perl(Bio::AlignIO::pfam)
perl(Bio::AlignIO::phylip)
perl(Bio::AlignIO::po)
perl(Bio::AlignIO::prodom)
perl(Bio::AlignIO::psi)
perl(Bio::AlignIO::selex)
perl(Bio::AlignIO::stockholm)
perl(Bio::AnalysisI)
perl(Bio::AnalysisI::JobI)
perl(Bio::AnalysisParserI)
perl(Bio::AnalysisResultI)
perl(Bio::AnnotatableI)
perl(Bio::Annotation::AnnotationFactory)
perl(Bio::Annotation::Collection)
perl(Bio::Annotation::Comment)
perl(Bio::Annotation::DBLink)
perl(Bio::Annotation::OntologyTerm)
perl(Bio::Annotation::Reference)
perl(Bio::Annotation::SimpleValue)
perl(Bio::Annotation::StructuredValue)
perl(Bio::Annotation::Target)
perl(Bio::Annotation::TypeManager)
perl(Bio::AnnotationCollectionI)
perl(Bio::AnnotationI)
perl(Bio::Assembly::Contig)
perl(Bio::Assembly::ContigAnalysis)
perl(Bio::Assembly::IO)
perl(Bio::Assembly::IO::ace)
perl(Bio::Assembly::IO::phrap)
perl(Bio::Assembly::Scaffold)
perl(Bio::Assembly::ScaffoldI)
perl(Bio::Assembly::Singlet)
perl(Bio::Biblio)
perl(Bio::Biblio::Article)
perl(Bio::Biblio::BiblioBase)
perl(Bio::Biblio::Book)
perl(Bio::Biblio::BookArticle)
perl(Bio::Biblio::IO)
perl(Bio::Biblio::IO::medline2ref)
perl(Bio::Biblio::IO::medlinexml)
perl(Bio::Biblio::IO::pubmed2ref)
perl(Bio::Biblio::IO::pubmedxml)
perl(Bio::Biblio::Journal)
perl(Bio::Biblio::JournalArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineBook)
perl(Bio::Biblio::MedlineBookArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineJournal)
perl(Bio::Biblio::MedlineJournalArticle)
perl(Bio::Biblio::Organisation)
perl(Bio::Biblio::Patent)
perl(Bio::Biblio::Person)
perl(Bio::Biblio::Proceeding)
perl(Bio::Biblio::Provider)
perl(Bio::Biblio::PubmedArticle)
perl(Bio::Biblio::PubmedBookArticle)
perl(Bio::Biblio::PubmedJournalArticle)
perl(Bio::Biblio::Ref)
perl(Bio::Biblio::Service)
perl(Bio::Biblio::TechReport)
perl(Bio::Biblio::Thesis)
perl(Bio::Biblio::WebResource)
perl(Bio::Cluster::ClusterFactory)
perl(Bio::Cluster::FamilyI)
perl(Bio::Cluster::SequenceFamily)
perl(Bio::Cluster::UniGene)
perl(Bio::Cluster::UniGeneI)
perl(Bio::ClusterI)
perl(Bio::ClusterIO)
perl(Bio::ClusterIO::dbsnp)
perl(Bio::ClusterIO::unigene)
perl(Bio::CodonUsage::IO)
perl(Bio::CodonUsage::Table)
perl(Bio::Coordinate::Chain)
perl(Bio::Coordinate::Collection)
perl(Bio::Coordinate::ExtrapolatingPair)
perl(Bio::Coordinate::GeneMapper)
perl(Bio::Coordinate::Graph)
perl(Bio::Coordinate::MapperI)
perl(Bio::Coordinate::Pair)
perl(Bio::Coordinate::Result)
perl(Bio::Coordinate::Result::Gap)
perl(Bio::Coordinate::Result::Match)
perl(Bio::Coordinate::ResultI)
perl(Bio::Coordinate::Utils)
perl(Bio::DB::Ace)
perl(Bio::DB::Biblio::biofetch)
perl(Bio::DB::Biblio::eutils)
perl(Bio::DB::Biblio::pdf)
perl(Bio::DB::Biblio::soap)
perl(Bio::DB::BiblioI)
perl(Bio::DB::BioFetch)
perl(Bio::DB::CUTG)
perl(Bio::DB::DBFetch)
perl(Bio::DB::EMBL)
perl(Bio::DB::Failover)
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perl(Bio::DB::Fasta::Stream)
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perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::oracleace)
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perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_genscan)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_refgene)
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perl(Bio::DB::XEMBL)
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perl(Bio::Das::SegmentI)
perl(Bio::DasI)
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perl(Bio::Expression::FeatureGroup::FeatureGroupMas50)
perl(Bio::Expression::FeatureI)
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perl(Bio::Factory::LocationFactoryI)
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perl(Bio::Factory::ObjectFactory)
perl(Bio::Factory::ObjectFactoryI)
perl(Bio::Factory::ResultFactoryI)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactory)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceProcessorI)
perl(Bio::Factory::SequenceStreamI)
perl(Bio::Factory::TreeFactoryI)
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perl(Bio::Graphics::FeatureFile)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::arrow)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::cds)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::merged_alignment)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::pentagram)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::splice_site)
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perl(Bio::Index::EMBL)
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perl(Bio::Map::Contig)
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perl(Bio::Map::CytoMarker)
perl(Bio::Map::CytoPosition)
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perl(Bio::Map::LinkageMap)
perl(Bio::Map::LinkagePosition)
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perl(Bio::Map::MappableI)
perl(Bio::Map::Marker)
perl(Bio::Map::MarkerI)
perl(Bio::Map::Microsatellite)
perl(Bio::Map::OrderedPosition)
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perl(Bio::Map::Position)
perl(Bio::Map::PositionI)
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perl(Bio::Matrix::IO)
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perl(Bio::Matrix::PSM::IO::mast)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::masta)
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perl(Bio::Matrix::Scoring)
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perl(Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine)
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perl(Bio::Restriction::IO)
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perl(Bio::Root::IO)
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perl(Bio::Root::Object)
perl(Bio::Root::Root)
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perl(Bio::Search::GenericStatistics)
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perl(Bio::Search::HSP::HSPI)
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perl(Bio::Search::HSP::PsiBlastHSP)
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perl(Bio::Search::Hit::PsiBlastHit)
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perl(Bio::Search::SearchUtils)
perl(Bio::Search::StatisticsI)
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perl(Bio::SearchIO::megablast)
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perl(Bio::SearchIO::wise)
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perl(Bio::Seq::EncodedSeq)
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perl(Bio::Seq::QualI)
perl(Bio::Seq::Quality)
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perl(Bio::Seq::SeqFactory)
perl(Bio::Seq::SeqFastaSpeedFactory)
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perl(Bio::SeqFeature::Collection)
perl(Bio::SeqFeature::CollectionI)
perl(Bio::SeqFeature::Computation)
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perl(Bio::SeqFeature::Gene::ExonI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructureI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Intron)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::NC_Feature)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Poly_A_site)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Promoter)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Transcript)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::TranscriptI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::UTR)
perl(Bio::SeqFeature::Generic)
perl(Bio::SeqFeature::PositionProxy)
perl(Bio::SeqFeature::Primer)
perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Oligo)
perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Pair)
perl(Bio::SeqFeature::Similarity)
perl(Bio::SeqFeature::SimilarityPair)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::FeatureNamer)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::IDHandler)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::TypeMapper)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::Unflattener)
perl(Bio::SeqFeature::TypedSeqFeatureI)
perl(Bio::SeqFeatureI)
perl(Bio::SeqI)
perl(Bio::SeqIO)
perl(Bio::SeqIO::FTHelper)
perl(Bio::SeqIO::MultiFile)
perl(Bio::SeqIO::abi)
perl(Bio::SeqIO::ace)
perl(Bio::SeqIO::agave)
perl(Bio::SeqIO::alf)
perl(Bio::SeqIO::asciitree)
perl(Bio::SeqIO::bsml)
perl(Bio::SeqIO::bsml_sax)
perl(Bio::SeqIO::chadoxml)
perl(Bio::SeqIO::chaos)
perl(Bio::SeqIO::chaosxml)
perl(Bio::SeqIO::ctf)
perl(Bio::SeqIO::embl)
perl(Bio::SeqIO::entrezgene)
perl(Bio::SeqIO::exp)
perl(Bio::SeqIO::fasta)
perl(Bio::SeqIO::fastq)
perl(Bio::SeqIO::game)
perl(Bio::SeqIO::game::featHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameSubs)
perl(Bio::SeqIO::game::gameWriter)
perl(Bio::SeqIO::game::seqHandler)
perl(Bio::SeqIO::gcg)
perl(Bio::SeqIO::genbank)
perl(Bio::SeqIO::interpro)
perl(Bio::SeqIO::kegg)
perl(Bio::SeqIO::largefasta)
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Requires :
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perl(Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder)
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perl(SVG::Graph)
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perl(Dumpvalue)
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Content of RPM :
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/usr/bin/bp_heterogeneity_test.pl
/usr/bin/bp_hmmer_to_table.pl
/usr/bin/bp_index.pl
/usr/bin/bp_load_gff.pl
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