RPM Other perl-bioperl 1.2 noarch rpm

perl-bioperl rpm build for : Other. For other distributions click perl-bioperl.

Name : perl-bioperl
Version : 1.2	Vendor : (none)
Release : 8	Date : 2003-08-27 10:58:03
Group : Development/Libraries	Source RPM : perl-bioperl-1.2-8.src.rpm
Size : 6.03 MB
Packager : rpmpan < wkevinp_users_sourceforge_net>
Summary : bioperl Perl module
Description : bioperl Perl module.
RPM found in directory: /packages/linux-pbone/archive/www.quantumlinux.com/%7Ekevin/rpmpan/rpm

Content of RPM Changelog Provides Requires

Download
ftp.icm.edu.pl perl-bioperl-1.2-8.noarch.rpm

Provides :
perl(Bio::Align::AlignI)
perl(Bio::Align::DNAStatistics)
perl(Bio::Align::PairwiseStatistics)
perl(Bio::Align::StatisticsI)
perl(Bio::Align::Utilities)
perl(Bio::AlignIO)
perl(Bio::AlignIO::bl2seq)
perl(Bio::AlignIO::clustalw)
perl(Bio::AlignIO::emboss)
perl(Bio::AlignIO::fasta)
perl(Bio::AlignIO::mase)
perl(Bio::AlignIO::mega)
perl(Bio::AlignIO::meme)
perl(Bio::AlignIO::msf)
perl(Bio::AlignIO::nexus)
perl(Bio::AlignIO::pfam)
perl(Bio::AlignIO::phylip)
perl(Bio::AlignIO::prodom)
perl(Bio::AlignIO::psi)
perl(Bio::AlignIO::selex)
perl(Bio::AlignIO::stockholm)
perl(Bio::AnalysisParserI)
perl(Bio::AnalysisResultI)
perl(Bio::AnnotatableI)
perl(Bio::Annotation::AnnotationFactory)
perl(Bio::Annotation::Collection)
perl(Bio::Annotation::Comment)
perl(Bio::Annotation::DBLink)
perl(Bio::Annotation::OntologyTerm)
perl(Bio::Annotation::Reference)
perl(Bio::Annotation::SimpleValue)
perl(Bio::Annotation::StructuredValue)
perl(Bio::Annotation::TypeManager)
perl(Bio::AnnotationCollectionI)
perl(Bio::AnnotationI)
perl(Bio::Assembly::Contig)
perl(Bio::Assembly::ContigAnalysis)
perl(Bio::Assembly::IO)
perl(Bio::Assembly::IO::ace)
perl(Bio::Assembly::IO::phrap)
perl(Bio::Assembly::Scaffold)
perl(Bio::Assembly::ScaffoldI)
perl(Bio::Biblio)
perl(Bio::Biblio::Article)
perl(Bio::Biblio::BiblioBase)
perl(Bio::Biblio::Book)
perl(Bio::Biblio::BookArticle)
perl(Bio::Biblio::IO)
perl(Bio::Biblio::IO::medline2ref)
perl(Bio::Biblio::IO::medlinexml)
perl(Bio::Biblio::IO::pubmed2ref)
perl(Bio::Biblio::IO::pubmedxml)
perl(Bio::Biblio::Journal)
perl(Bio::Biblio::JournalArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineBook)
perl(Bio::Biblio::MedlineBookArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineJournal)
perl(Bio::Biblio::MedlineJournalArticle)
perl(Bio::Biblio::Organisation)
perl(Bio::Biblio::Patent)
perl(Bio::Biblio::Person)
perl(Bio::Biblio::Proceeding)
perl(Bio::Biblio::Provider)
perl(Bio::Biblio::PubmedArticle)
perl(Bio::Biblio::PubmedBookArticle)
perl(Bio::Biblio::PubmedJournalArticle)
perl(Bio::Biblio::Ref)
perl(Bio::Biblio::Service)
perl(Bio::Biblio::TechReport)
perl(Bio::Biblio::Thesis)
perl(Bio::Biblio::WebResource)
perl(Bio::Cluster::ClusterFactory)
perl(Bio::Cluster::FamilyI)
perl(Bio::Cluster::SequenceFamily)
perl(Bio::Cluster::UniGene)
perl(Bio::Cluster::UniGeneI)
perl(Bio::ClusterI)
perl(Bio::ClusterIO)
perl(Bio::ClusterIO::dbsnp)
perl(Bio::ClusterIO::unigene)
perl(Bio::Coordinate::Chain)
perl(Bio::Coordinate::Collection)
perl(Bio::Coordinate::ExtrapolatingPair)
perl(Bio::Coordinate::GeneMapper)
perl(Bio::Coordinate::Graph)
perl(Bio::Coordinate::MapperI)
perl(Bio::Coordinate::Pair)
perl(Bio::Coordinate::Result)
perl(Bio::Coordinate::Result::Gap)
perl(Bio::Coordinate::Result::Match)
perl(Bio::Coordinate::Utils)
perl(Bio::DB::Ace)
perl(Bio::DB::Biblio::biofetch)
perl(Bio::DB::Biblio::soap)
perl(Bio::DB::BiblioI)
perl(Bio::DB::BioFetch)
perl(Bio::DB::DBFetch)
perl(Bio::DB::EMBL)
perl(Bio::DB::Failover)
perl(Bio::DB::Fasta)
perl(Bio::DB::Fasta::Stream)
perl(Bio::DB::FileCache)
perl(Bio::DB::Flat)
perl(Bio::DB::Flat::BDB)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::embl)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::fasta)
perl(Bio::DB::Flat::OBDAIndex)
perl(Bio::DB::GDB)
perl(Bio::DB::GFF)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::ace)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::caching_handle)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::faux_dbh)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::faux_sth)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::iterator)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysql)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlace)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlopt)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::oracle)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::oracleace)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::memory)
perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::memory_iterator)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::alignment)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::clone)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::none)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::transcript)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_acembly)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_ensgene)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_genscan)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_refgene)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_sanger22)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_sanger22pseudo)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_softberry)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_twinscan)
perl(Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_unigene)
perl(Bio::DB::GFF::Featname)
perl(Bio::DB::GFF::Feature)
perl(Bio::DB::GFF::Homol)
perl(Bio::DB::GFF::ID_Iterator)
perl(Bio::DB::GFF::RelSegment)
perl(Bio::DB::GFF::Segment)
perl(Bio::DB::GFF::Typename)
perl(Bio::DB::GFF::Util::Binning)
perl(Bio::DB::GFF::Util::Rearrange)
perl(Bio::DB::GenBank)
perl(Bio::DB::GenPept)
perl(Bio::DB::InMemoryCache)
perl(Bio::DB::NCBIHelper)
perl(Bio::DB::Query::GenBank)
perl(Bio::DB::Query::WebQuery)
perl(Bio::DB::QueryI)
perl(Bio::DB::RandomAccessI)
perl(Bio::DB::RefSeq)
perl(Bio::DB::Registry)
perl(Bio::DB::SeqI)
perl(Bio::DB::SwissProt)
perl(Bio::DB::Universal)
perl(Bio::DB::UpdateableSeqI)
perl(Bio::DB::WebDBSeqI)
perl(Bio::DB::XEMBL)
perl(Bio::DB::XEMBLService)
perl(Bio::DBLinkContainerI)
perl(Bio::Das::FeatureTypeI)
perl(Bio::Das::SegmentI)
perl(Bio::DasI)
perl(Bio::DescribableI)
perl(Bio::Event::EventGeneratorI)
perl(Bio::Event::EventHandlerI)
perl(Bio::Expression::FeatureI)
perl(Bio::Expression::FeatureSet)
perl(Bio::Factory::ApplicationFactoryI)
perl(Bio::Factory::BlastHitFactory)
perl(Bio::Factory::BlastResultFactory)
perl(Bio::Factory::DriverFactory)
perl(Bio::Factory::EMBOSS)
perl(Bio::Factory::FTLocationFactory)
perl(Bio::Factory::HitFactoryI)
perl(Bio::Factory::LocationFactoryI)
perl(Bio::Factory::MapFactoryI)
perl(Bio::Factory::ObjectBuilderI)
perl(Bio::Factory::ObjectFactoryI)
perl(Bio::Factory::ResultFactoryI)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactory)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceProcessorI)
perl(Bio::Factory::SequenceStreamI)
perl(Bio::Factory::TreeFactoryI)
perl(Bio::FeatureHolderI)
perl(Bio::Graphics)
perl(Bio::Graphics::Feature)
perl(Bio::Graphics::FeatureFile)
perl(Bio::Graphics::Glyph)
perl(Bio::Graphics::Glyph::Factory)
perl(Bio::Graphics::Glyph::alignment)
perl(Bio::Graphics::Glyph::anchored_arrow)
perl(Bio::Graphics::Glyph::arrow)
perl(Bio::Graphics::Glyph::box)
perl(Bio::Graphics::Glyph::cds)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::diamond)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::line)
perl(Bio::Graphics::Glyph::oval)
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perl(Bio::Graphics::Glyph::primers)
perl(Bio::Graphics::Glyph::rndrect)
perl(Bio::Graphics::Glyph::ruler_arrow)
perl(Bio::Graphics::Glyph::segmented_keyglyph)
perl(Bio::Graphics::Glyph::segments)
perl(Bio::Graphics::Glyph::span)
perl(Bio::Graphics::Glyph::toomany)
perl(Bio::Graphics::Glyph::track)
perl(Bio::Graphics::Glyph::transcript)
perl(Bio::Graphics::Glyph::transcript2)
perl(Bio::Graphics::Glyph::translation)
perl(Bio::Graphics::Glyph::triangle)
perl(Bio::Graphics::Panel)
perl(Bio::Graphics::Util)
perl(Bio::IdCollectionI)
perl(Bio::IdentifiableI)
perl(Bio::Index::Abstract)
perl(Bio::Index::AbstractSeq)
perl(Bio::Index::Blast)
perl(Bio::Index::EMBL)
perl(Bio::Index::Fasta)
perl(Bio::Index::Fastq)
perl(Bio::Index::GenBank)
perl(Bio::Index::SwissPfam)
perl(Bio::Index::Swissprot)
perl(Bio::LiveSeq::AARange)
perl(Bio::LiveSeq::Chain)
perl(Bio::LiveSeq::ChainI)
perl(Bio::LiveSeq::DNA)
perl(Bio::LiveSeq::Exon)
perl(Bio::LiveSeq::Gene)
perl(Bio::LiveSeq::IO::BioPerl)
perl(Bio::LiveSeq::IO::Loader)
perl(Bio::LiveSeq::IO::SRS)
perl(Bio::LiveSeq::Intron)
perl(Bio::LiveSeq::Mutation)
perl(Bio::LiveSeq::Mutator)
perl(Bio::LiveSeq::Prim_Transcript)
perl(Bio::LiveSeq::Range)
perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Region)
perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Unit)
perl(Bio::LiveSeq::SeqI)
perl(Bio::LiveSeq::Transcript)
perl(Bio::LiveSeq::Translation)
perl(Bio::LocatableSeq)
perl(Bio::Location::Atomic)
perl(Bio::Location::AvWithinCoordPolicy)
perl(Bio::Location::CoordinatePolicyI)
perl(Bio::Location::Fuzzy)
perl(Bio::Location::FuzzyLocationI)
perl(Bio::Location::NarrowestCoordPolicy)
perl(Bio::Location::Simple)
perl(Bio::Location::Split)
perl(Bio::Location::SplitLocationI)
perl(Bio::Location::WidestCoordPolicy)
perl(Bio::LocationI)
perl(Bio::Map::CytoMap)
perl(Bio::Map::CytoMarker)
perl(Bio::Map::CytoPosition)
perl(Bio::Map::LinkageMap)
perl(Bio::Map::LinkagePosition)
perl(Bio::Map::MapI)
perl(Bio::Map::MappableI)
perl(Bio::Map::Marker)
perl(Bio::Map::MarkerI)
perl(Bio::Map::Microsatellite)
perl(Bio::Map::OrderedPosition)
perl(Bio::Map::OrderedPositionWithDistance)
perl(Bio::Map::Position)
perl(Bio::Map::PositionI)
perl(Bio::Map::SimpleMap)
perl(Bio::MapIO)
perl(Bio::MapIO::mapmaker)
perl(Bio::Matrix::PhylipDist)
perl(Bio::Ontology::GOterm)
perl(Bio::Ontology::OntologyEngineI)
perl(Bio::Ontology::Relationship)
perl(Bio::Ontology::RelationshipI)
perl(Bio::Ontology::RelationshipType)
perl(Bio::Ontology::SimpleGOEngine)
perl(Bio::Ontology::Term)
perl(Bio::Ontology::TermFactory)
perl(Bio::Ontology::TermI)
perl(Bio::OntologyIO::simpleGOparser)
perl(Bio::Perl)
perl(Bio::Phenotype::Correlate)
perl(Bio::Phenotype::Measure)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::MiniMIMentry)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentry)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentryAllelicVariant)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMparser)
perl(Bio::Phenotype::Phenotype)
perl(Bio::Phenotype::PhenotypeI)
perl(Bio::PrimarySeq)
perl(Bio::PrimarySeq::Fasta)
perl(Bio::PrimarySeqI)
perl(Bio::Range)
perl(Bio::RangeI)
perl(Bio::Root::Err)
perl(Bio::Root::Exception)
perl(Bio::Root::Global)
perl(Bio::Root::HTTPget)
perl(Bio::Root::IO)
perl(Bio::Root::IOManager)
perl(Bio::Root::Object)
perl(Bio::Root::Root)
perl(Bio::Root::RootI)
perl(Bio::Root::Utilities)
perl(Bio::Root::Vector)
perl(Bio::Root::Xref)
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perl(Bio::Search::DatabaseI)
perl(Bio::Search::GenericDatabase)
perl(Bio::Search::HSP::BlastHSP)
perl(Bio::Search::HSP::FastaHSP)
perl(Bio::Search::HSP::GenericHSP)
perl(Bio::Search::HSP::HMMERHSP)
perl(Bio::Search::HSP::HSPFactory)
perl(Bio::Search::HSP::HSPI)
perl(Bio::Search::HSP::WABAHSP)
perl(Bio::Search::Hit::BlastHit)
perl(Bio::Search::Hit::Fasta)
perl(Bio::Search::Hit::GenericHit)
perl(Bio::Search::Hit::HMMERHit)
perl(Bio::Search::Hit::HitFactory)
perl(Bio::Search::Hit::HitI)
perl(Bio::Search::Processor)
perl(Bio::Search::Result::BlastResult)
perl(Bio::Search::Result::GenericResult)
perl(Bio::Search::Result::HMMERResult)
perl(Bio::Search::Result::ResultFactory)
perl(Bio::Search::Result::ResultI)
perl(Bio::Search::Result::WABAResult)
perl(Bio::Search::SearchUtils)
perl(Bio::SearchDist)
perl(Bio::SearchIO)
perl(Bio::SearchIO::EventHandlerI)
perl(Bio::SearchIO::FastHitEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchWriterI)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HSPTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HTMLResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HitTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::ResultTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::TextResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::blast)
perl(Bio::SearchIO::blastxml)
perl(Bio::SearchIO::chado)
perl(Bio::SearchIO::chadosxpr)
perl(Bio::SearchIO::exonerate)
perl(Bio::SearchIO::fasta)
perl(Bio::SearchIO::hmmer)
perl(Bio::SearchIO::psiblast)
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perl(Bio::Seq)
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perl(Bio::Seq::LargeSeq)
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perl(Bio::SeqFeature::AnnotationAdaptor)
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perl(Bio::SeqFeature::Computation)
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perl(Bio::SeqFeature::Gene::Exon)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::ExonI)
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perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructureI)
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perl(Bio::SeqFeature::Gene::TranscriptI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::UTR)
perl(Bio::SeqFeature::Generic)
perl(Bio::SeqFeature::PositionProxy)
perl(Bio::SeqFeature::Primer)
perl(Bio::SeqFeature::Similarity)
perl(Bio::SeqFeature::SimilarityPair)
perl(Bio::SeqFeatureI)
perl(Bio::SeqI)
perl(Bio::SeqIO)
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perl(Bio::SeqIO::MultiFile)
perl(Bio::SeqIO::abi)
perl(Bio::SeqIO::ace)
perl(Bio::SeqIO::alf)
perl(Bio::SeqIO::bsml)
perl(Bio::SeqIO::chado)
perl(Bio::SeqIO::chadoitext)
perl(Bio::SeqIO::chadosxpr)
perl(Bio::SeqIO::chadoxml)
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perl(Bio::SeqIO::embl)
perl(Bio::SeqIO::exp)
perl(Bio::SeqIO::fasta)
perl(Bio::SeqIO::fastq)
perl(Bio::SeqIO::game)
perl(Bio::SeqIO::game::featureHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::idHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::seqHandler)
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perl(Bio::SeqIO::locuslink)
perl(Bio::SeqIO::phd)
perl(Bio::SeqIO::pir)
perl(Bio::SeqIO::pln)
perl(Bio::SeqIO::qual)
perl(Bio::SeqIO::raw)
perl(Bio::SeqIO::scf)
perl(Bio::SeqIO::swiss)
perl(Bio::SeqIO::ztr)
perl(Bio::SeqUtils)
perl(Bio::SimpleAlign)
perl(Bio::Species)
perl(Bio::Structure::Atom)
perl(Bio::Structure::Chain)
perl(Bio::Structure::Entry)
perl(Bio::Structure::IO)
perl(Bio::Structure::IO::pdb)
perl(Bio::Structure::Model)
perl(Bio::Structure::Residue)
perl(Bio::Structure::SecStr::DSSP::Res)
perl(Bio::Structure::SecStr::STRIDE::Res)
perl(Bio::Structure::StructureI)
perl(Bio::Symbol::Alphabet)
perl(Bio::Symbol::AlphabetI)
perl(Bio::Symbol::DNAAlphabet)
perl(Bio::Symbol::ProteinAlphabet)
perl(Bio::Symbol::Symbol)
perl(Bio::Symbol::SymbolI)
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perl(Bio::Taxonomy::Taxon)
perl(Bio::Taxonomy::Tree)
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perl(Bio::Tools::Alignment::Consed)
perl(Bio::Tools::Alignment::Trim)
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perl(Bio::Tools::BPlite::Iteration)
perl(Bio::Tools::BPlite::Sbjct)
perl(Bio::Tools::BPpsilite)
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perl(Bio::Tools::Blast::HSP)
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perl(Bio::Tools::Blast::Sbjct)
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perl(Bio::Tools::Phylo::PAML::Result)
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perl(Bio::Tools::Run::StandAloneBlast)
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perl(Bio::Tools::SeqAnal)
perl(Bio::Tools::SeqPattern)
perl(Bio::Tools::SeqStats)
perl(Bio::Tools::SeqWords)
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perl(Bio::Tools::StateMachine::IOStateMachine)
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perl(Bio::Tools::pSW)
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perl(Bio::Tree::Node)
perl(Bio::Tree::NodeI)
perl(Bio::Tree::NodeNHX)
perl(Bio::Tree::RandomFactory)
perl(Bio::Tree::Statistics)
perl(Bio::Tree::Tree)
perl(Bio::Tree::TreeFunctionsI)
perl(Bio::Tree::TreeI)
perl(Bio::TreeIO)
perl(Bio::TreeIO::TreeEventBuilder)
perl(Bio::TreeIO::newick)
perl(Bio::TreeIO::nhx)
perl(Bio::TreeIO::tabtree)
perl(Bio::UpdateableSeqI)
perl(Bio::Variation::AAChange)
perl(Bio::Variation::AAReverseMutate)
perl(Bio::Variation::Allele)
perl(Bio::Variation::DNAMutation)
perl(Bio::Variation::IO)
perl(Bio::Variation::IO::flat)
perl(Bio::Variation::IO::xml)
perl(Bio::Variation::RNAChange)
perl(Bio::Variation::SNP)
perl(Bio::Variation::SeqDiff)
perl(Bio::Variation::VariantI)
perl(LocalConfig)
perl-bioperl

Requires :

rpmlib(CompressedFileNames) <= 3.0.4-1

rpmlib(VersionedDependencies) <= 3.0.3-1

rpmlib(PayloadFilesHavePrefix) <= 4.0-1

Content of RPM :
/usr/lib/perl5/site_perl/5.6.1/Bio/Align/AlignI.pm
/usr/lib/perl5/site_perl/5.6.1/Bio/Align/DNAStatistics.pm
/usr/lib/perl5/site_perl/5.6.1/Bio/Align/PairwiseStatistics.pm
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