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perl-BioPerl rpm build for : Mageia 9. For other distributions click perl-BioPerl.

Name : perl-BioPerl
Version : 1.7.8 Vendor : Mageia_Org
Release : 3.mga9 Date : 2022-03-28 20:12:57
Group : Development/Perl Source RPM : perl-BioPerl-1.7.8-3.mga9.src.rpm
Size : 8.32 MB
Packager : umeabot < umeabot>
Summary : BioPerl core modules
Description :
Officially organized in 1995 and existing informally for several years
prior, The Bioperl Project is an international association of developers
of open source Perl tools for bioinformatics, genomics and life science
research.

RPM found in directory: /vol/rzm3/linux-mageia/distrib/9/x86_64/media/core/release

Content of RPM  Changelog  Provides Requires

Download
ftp.icm.edu.pl  perl-BioPerl-1.7.8-3.mga9.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-BioPerl-1.7.8-3.mga9.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-BioPerl-1.7.8-3.mga9.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-BioPerl-1.7.8-3.mga9.noarch.rpm
     

Provides :
perl(Bio::Align::AlignI)
perl(Bio::Align::DNAStatistics)
perl(Bio::Align::PairwiseStatistics)
perl(Bio::Align::ProteinStatistics)
perl(Bio::Align::StatisticsI)
perl(Bio::Align::Utilities)
perl(Bio::AlignIO)
perl(Bio::AlignIO::Handler::GenericAlignHandler)
perl(Bio::AlignIO::arp)
perl(Bio::AlignIO::bl2seq)
perl(Bio::AlignIO::clustalw)
perl(Bio::AlignIO::emboss)
perl(Bio::AlignIO::fasta)
perl(Bio::AlignIO::largemultifasta)
perl(Bio::AlignIO::maf)
perl(Bio::AlignIO::mase)
perl(Bio::AlignIO::mega)
perl(Bio::AlignIO::meme)
perl(Bio::AlignIO::metafasta)
perl(Bio::AlignIO::msf)
perl(Bio::AlignIO::nexus)
perl(Bio::AlignIO::pfam)
perl(Bio::AlignIO::phylip)
perl(Bio::AlignIO::po)
perl(Bio::AlignIO::proda)
perl(Bio::AlignIO::prodom)
perl(Bio::AlignIO::psi)
perl(Bio::AlignIO::selex)
perl(Bio::AlignIO::xmfa)
perl(Bio::AnalysisI)
perl(Bio::AnalysisI::JobI)
perl(Bio::AnalysisParserI)
perl(Bio::AnalysisResultI)
perl(Bio::AnnotatableI)
perl(Bio::Annotation::AnnotationFactory)
perl(Bio::Annotation::Collection)
perl(Bio::Annotation::Comment)
perl(Bio::Annotation::DBLink)
perl(Bio::Annotation::OntologyTerm)
perl(Bio::Annotation::Reference)
perl(Bio::Annotation::Relation)
perl(Bio::Annotation::SimpleValue)
perl(Bio::Annotation::StructuredValue)
perl(Bio::Annotation::TagTree)
perl(Bio::Annotation::Target)
perl(Bio::Annotation::Tree)
perl(Bio::Annotation::TypeManager)
perl(Bio::AnnotationCollectionI)
perl(Bio::AnnotationI)
perl(Bio::CodonUsage::IO)
perl(Bio::CodonUsage::Table)
perl(Bio::DB::DBFetch)
perl(Bio::DB::Failover)
perl(Bio::DB::Fasta)
perl(Bio::DB::FileCache)
perl(Bio::DB::Flat)
perl(Bio::DB::Flat::BDB)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::embl)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::fasta)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::genbank)
perl(Bio::DB::Flat::BDB::swiss)
perl(Bio::DB::Flat::BinarySearch)
perl(Bio::DB::GFF::Util::Binning)
perl(Bio::DB::GFF::Util::Rearrange)
perl(Bio::DB::GenericWebAgent)
perl(Bio::DB::InMemoryCache)
perl(Bio::DB::Indexed::Stream)
perl(Bio::DB::IndexedBase)
perl(Bio::DB::LocationI)
perl(Bio::DB::Qual)
perl(Bio::DB::Query::WebQuery)
perl(Bio::DB::QueryI)
perl(Bio::DB::RandomAccessI)
perl(Bio::DB::ReferenceI)
perl(Bio::DB::Registry)
perl(Bio::DB::SeqI)
perl(Bio::DB::Taxonomy)
perl(Bio::DB::Taxonomy::flatfile)
perl(Bio::DB::Taxonomy::greengenes)
perl(Bio::DB::Taxonomy::list)
perl(Bio::DB::Taxonomy::silva)
perl(Bio::DB::UpdateableSeqI)
perl(Bio::DB::WebDBSeqI)
perl(Bio::DBLinkContainerI)
perl(Bio::Das::FeatureTypeI)
perl(Bio::Das::SegmentI)
perl(Bio::DasI)
perl(Bio::DescribableI)
perl(Bio::Event::EventGeneratorI)
perl(Bio::Event::EventHandlerI)
perl(Bio::Factory::AnalysisI)
perl(Bio::Factory::ApplicationFactoryI)
perl(Bio::Factory::DriverFactory)
perl(Bio::Factory::FTLocationFactory)
perl(Bio::Factory::LocationFactoryI)
perl(Bio::Factory::ObjectBuilderI)
perl(Bio::Factory::ObjectFactory)
perl(Bio::Factory::ObjectFactoryI)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactory)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceProcessorI)
perl(Bio::Factory::SequenceStreamI)
perl(Bio::Factory::TreeFactoryI)
perl(Bio::FeatureHolderI)
perl(Bio::HandlerBaseI)
perl(Bio::IdCollectionI)
perl(Bio::IdentifiableI)
perl(Bio::Index::Abstract)
perl(Bio::Index::AbstractSeq)
perl(Bio::Index::Blast)
perl(Bio::Index::BlastTable)
perl(Bio::Index::EMBL)
perl(Bio::Index::Fasta)
perl(Bio::Index::Fastq)
perl(Bio::Index::GenBank)
perl(Bio::Index::Qual)
perl(Bio::Index::SwissPfam)
perl(Bio::Index::Swissprot)
perl(Bio::LocatableSeq)
perl(Bio::Location::Atomic)
perl(Bio::Location::AvWithinCoordPolicy)
perl(Bio::Location::CoordinatePolicyI)
perl(Bio::Location::Fuzzy)
perl(Bio::Location::FuzzyLocationI)
perl(Bio::Location::NarrowestCoordPolicy)
perl(Bio::Location::Simple)
perl(Bio::Location::Split)
perl(Bio::Location::SplitLocationI)
perl(Bio::Location::WidestCoordPolicy)
perl(Bio::LocationI)
perl(Bio::Matrix::Generic)
perl(Bio::Matrix::IO)
perl(Bio::Matrix::IO::mlagan)
perl(Bio::Matrix::IO::phylip)
perl(Bio::Matrix::IO::scoring)
perl(Bio::Matrix::MatrixI)
perl(Bio::Matrix::Mlagan)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::mast)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::masta)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::meme)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::psiblast)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::transfac)
perl(Bio::Matrix::PSM::InstanceSite)
perl(Bio::Matrix::PSM::InstanceSiteI)
perl(Bio::Matrix::PSM::ProtMatrix)
perl(Bio::Matrix::PSM::ProtPsm)
perl(Bio::Matrix::PSM::Psm)
perl(Bio::Matrix::PSM::PsmHeader)
perl(Bio::Matrix::PSM::PsmHeaderI)
perl(Bio::Matrix::PSM::PsmI)
perl(Bio::Matrix::PSM::SiteMatrix)
perl(Bio::Matrix::PSM::SiteMatrixI)
perl(Bio::Matrix::PhylipDist)
perl(Bio::Matrix::Scoring)
perl(Bio::Ontology::DocumentRegistry)
perl(Bio::Ontology::GOterm)
perl(Bio::Ontology::InterProTerm)
perl(Bio::Ontology::OBOEngine)
perl(Bio::Ontology::OBOterm)
perl(Bio::Ontology::Ontology)
perl(Bio::Ontology::OntologyEngineI)
perl(Bio::Ontology::OntologyI)
perl(Bio::Ontology::OntologyStore)
perl(Bio::Ontology::Path)
perl(Bio::Ontology::PathI)
perl(Bio::Ontology::Relationship)
perl(Bio::Ontology::RelationshipFactory)
perl(Bio::Ontology::RelationshipI)
perl(Bio::Ontology::RelationshipType)
perl(Bio::Ontology::SimpleGOEngine::GraphAdaptor)
perl(Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine)
perl(Bio::Ontology::Term)
perl(Bio::Ontology::TermFactory)
perl(Bio::Ontology::TermI)
perl(Bio::OntologyIO)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::BaseSAXHandler)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterProHandler)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterPro_BioSQL_Handler)
perl(Bio::OntologyIO::InterProParser)
perl(Bio::OntologyIO::dagflat)
perl(Bio::OntologyIO::goflat)
perl(Bio::OntologyIO::obo)
perl(Bio::OntologyIO::simplehierarchy)
perl(Bio::OntologyIO::soflat)
perl(Bio::ParameterBaseI)
perl(Bio::PrimarySeq)
perl(Bio::PrimarySeq::Fasta)
perl(Bio::PrimarySeqI)
perl(Bio::PullParserI)
perl(Bio::Range)
perl(Bio::RangeI)
perl(Bio::Root::Exception)
perl(Bio::Root::HTTPget)
perl(Bio::Root::IO)
perl(Bio::Root::Root)
perl(Bio::Root::RootI)
perl(Bio::Root::Storable)
perl(Bio::Root::Test)
perl(Bio::Root::TestObject)
perl(Bio::Root::Utilities)
perl(Bio::Root::Version)
perl(Bio::Search::BlastStatistics)
perl(Bio::Search::BlastUtils)
perl(Bio::Search::DatabaseI)
perl(Bio::Search::GenericDatabase)
perl(Bio::Search::GenericStatistics)
perl(Bio::Search::HSP::BlastHSP)
perl(Bio::Search::HSP::BlastPullHSP)
perl(Bio::Search::HSP::FastaHSP)
perl(Bio::Search::HSP::GenericHSP)
perl(Bio::Search::HSP::HSPFactory)
perl(Bio::Search::HSP::HSPI)
perl(Bio::Search::HSP::ModelHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PSLHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PsiBlastHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PullHSPI)
perl(Bio::Search::HSP::WABAHSP)
perl(Bio::Search::Hit::BlastHit)
perl(Bio::Search::Hit::BlastPullHit)
perl(Bio::Search::Hit::Fasta)
perl(Bio::Search::Hit::GenericHit)
perl(Bio::Search::Hit::HitFactory)
perl(Bio::Search::Hit::HitI)
perl(Bio::Search::Hit::ModelHit)
perl(Bio::Search::Hit::PsiBlastHit)
perl(Bio::Search::Hit::PullHitI)
perl(Bio::Search::Iteration::GenericIteration)
perl(Bio::Search::Iteration::IterationI)
perl(Bio::Search::Processor)
perl(Bio::Search::Result::BlastPullResult)
perl(Bio::Search::Result::BlastResult)
perl(Bio::Search::Result::CrossMatchResult)
perl(Bio::Search::Result::GenericResult)
perl(Bio::Search::Result::INFERNALResult)
perl(Bio::Search::Result::PullResultI)
perl(Bio::Search::Result::ResultFactory)
perl(Bio::Search::Result::ResultI)
perl(Bio::Search::Result::WABAResult)
perl(Bio::Search::SearchUtils)
perl(Bio::Search::StatisticsI)
perl(Bio::Search::Tiling::MapTileUtils)
perl(Bio::Search::Tiling::MapTiling)
perl(Bio::Search::Tiling::TilingI)
perl(Bio::SearchIO)
perl(Bio::SearchIO::EventHandlerI)
perl(Bio::SearchIO::FastHitEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::IteratedSearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchWriterI)
perl(Bio::SearchIO::Writer::GbrowseGFF)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HSPTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HTMLResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HitTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::ResultTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::TextResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::axt)
perl(Bio::SearchIO::blast)
perl(Bio::SearchIO::blast_pull)
perl(Bio::SearchIO::blasttable)
perl(Bio::SearchIO::cross_match)
perl(Bio::SearchIO::erpin)
perl(Bio::SearchIO::exonerate)
perl(Bio::SearchIO::fasta)
perl(Bio::SearchIO::gmap_f9)
perl(Bio::SearchIO::infernal)
perl(Bio::SearchIO::megablast)
perl(Bio::SearchIO::psl)
perl(Bio::SearchIO::rnamotif)
perl(Bio::SearchIO::sim4)
perl(Bio::SearchIO::waba)
perl(Bio::SearchIO::wise)
perl(Bio::Seq)
perl(Bio::Seq::BaseSeqProcessor)
perl(Bio::Seq::EncodedSeq)
perl(Bio::Seq::LargeLocatableSeq)
perl(Bio::Seq::LargePrimarySeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeqI)
perl(Bio::Seq::Meta)
perl(Bio::Seq::Meta::Array)
perl(Bio::Seq::MetaI)
perl(Bio::Seq::PrimaryQual)
perl(Bio::Seq::PrimaryQual::Qual)
perl(Bio::Seq::PrimedSeq)
perl(Bio::Seq::QualI)
perl(Bio::Seq::Quality)
perl(Bio::Seq::RichSeq)
perl(Bio::Seq::RichSeqI)
perl(Bio::Seq::SeqBuilder)
perl(Bio::Seq::SeqFactory)
perl(Bio::Seq::SeqFastaSpeedFactory)
perl(Bio::Seq::SequenceTrace)
perl(Bio::Seq::SimulatedRead)
perl(Bio::Seq::TraceI)
perl(Bio::SeqAnalysisParserI)
perl(Bio::SeqFeature::Amplicon)
perl(Bio::SeqFeature::AnnotationAdaptor)
perl(Bio::SeqFeature::Collection)
perl(Bio::SeqFeature::CollectionI)
perl(Bio::SeqFeature::Computation)
perl(Bio::SeqFeature::FeaturePair)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Exon)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::ExonI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructureI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Intron)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::NC_Feature)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Poly_A_site)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Promoter)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Transcript)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::TranscriptI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::UTR)
perl(Bio::SeqFeature::Generic)
perl(Bio::SeqFeature::Lite)
perl(Bio::SeqFeature::PositionProxy)
perl(Bio::SeqFeature::Primer)
perl(Bio::SeqFeature::Similarity)
perl(Bio::SeqFeature::SimilarityPair)
perl(Bio::SeqFeature::SubSeq)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::FeatureNamer)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::IDHandler)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::TypeMapper)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::Unflattener)
perl(Bio::SeqFeature::TypedSeqFeatureI)
perl(Bio::SeqFeatureI)
perl(Bio::SeqI)
perl(Bio::SeqIO)
perl(Bio::SeqIO::FTHelper)
perl(Bio::SeqIO::Handler::GenericRichSeqHandler)
perl(Bio::SeqIO::MultiFile)
perl(Bio::SeqIO::ace)
perl(Bio::SeqIO::asciitree)
perl(Bio::SeqIO::bsml)
perl(Bio::SeqIO::bsml_sax)
perl(Bio::SeqIO::embl)
perl(Bio::SeqIO::embldriver)
perl(Bio::SeqIO::fasta)
perl(Bio::SeqIO::fastq)
perl(Bio::SeqIO::game)
perl(Bio::SeqIO::game::featHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameSubs)
perl(Bio::SeqIO::game::gameWriter)
perl(Bio::SeqIO::game::seqHandler)
perl(Bio::SeqIO::gbdriver)
perl(Bio::SeqIO::gbxml)
perl(Bio::SeqIO::gcg)
perl(Bio::SeqIO::genbank)
perl(Bio::SeqIO::kegg)
perl(Bio::SeqIO::largefasta)
perl(Bio::SeqIO::locuslink)
perl(Bio::SeqIO::mbsout)
perl(Bio::SeqIO::metafasta)
perl(Bio::SeqIO::msout)
perl(Bio::SeqIO::phd)
perl(Bio::SeqIO::pir)
perl(Bio::SeqIO::qual)
perl(Bio::SeqIO::raw)
perl(Bio::SeqIO::scf)
perl(Bio::SeqIO::seqxml)
perl(Bio::SeqIO::swiss)
perl(Bio::SeqIO::swissdriver)
perl(Bio::SeqIO::tab)
perl(Bio::SeqIO::table)
perl(Bio::SeqIO::tigr)
perl(Bio::SeqIO::tigrxml)
perl(Bio::SeqIO::tinyseq)
perl(Bio::SeqIO::tinyseq::tinyseqHandler)
perl(Bio::SeqUtils)
perl(Bio::SimpleAlign)
perl(Bio::SimpleAnalysisI)
perl(Bio::Species)
perl(Bio::Taxon)
perl(Bio::Tools::Alignment::Consed)
perl(Bio::Tools::Alignment::Trim)
perl(Bio::Tools::AmpliconSearch)
perl(Bio::Tools::Analysis::SimpleAnalysisBase)
perl(Bio::Tools::AnalysisResult)
perl(Bio::Tools::Blat)
perl(Bio::Tools::CodonTable)
perl(Bio::Tools::Coil)
perl(Bio::Tools::ECnumber)
perl(Bio::Tools::EMBOSS::Palindrome)
perl(Bio::Tools::EPCR)
perl(Bio::Tools::ESTScan)
perl(Bio::Tools::Eponine)
perl(Bio::Tools::Est2Genome)
perl(Bio::Tools::Fgenesh)
perl(Bio::Tools::FootPrinter)
perl(Bio::Tools::GFF)
perl(Bio::Tools::Geneid)
perl(Bio::Tools::Genemark)
perl(Bio::Tools::Genewise)
perl(Bio::Tools::Genomewise)
perl(Bio::Tools::Genscan)
perl(Bio::Tools::Glimmer)
perl(Bio::Tools::Grail)
perl(Bio::Tools::GuessSeqFormat)
perl(Bio::Tools::IUPAC)
perl(Bio::Tools::Lucy)
perl(Bio::Tools::MZEF)
perl(Bio::Tools::Match)
perl(Bio::Tools::OddCodes)
perl(Bio::Tools::Phylo::Gerp)
perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy)
perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy::Result)
perl(Bio::Tools::Phylo::Phylip::ProtDist)
perl(Bio::Tools::Prediction::Exon)
perl(Bio::Tools::Prediction::Gene)
perl(Bio::Tools::Primer3)
perl(Bio::Tools::Primer::Assessor::Base)
perl(Bio::Tools::Primer::AssessorI)
perl(Bio::Tools::Primer::Feature)
perl(Bio::Tools::Primer::Pair)
perl(Bio::Tools::Prints)
perl(Bio::Tools::Profile)
perl(Bio::Tools::Promoterwise)
perl(Bio::Tools::PrositeScan)
perl(Bio::Tools::Pseudowise)
perl(Bio::Tools::QRNA)
perl(Bio::Tools::RandomDistFunctions)
perl(Bio::Tools::RepeatMasker)
perl(Bio::Tools::Run::Analysis)
perl(Bio::Tools::Run::Analysis::Job)
perl(Bio::Tools::Run::Analysis::Utils)
perl(Bio::Tools::Run::AnalysisFactory)
perl(Bio::Tools::Run::GenericParameters)
perl(Bio::Tools::Run::ParametersI)
perl(Bio::Tools::Run::Phylo::PhyloBase)
perl(Bio::Tools::Run::WrapperBase)
perl(Bio::Tools::Seg)
perl(Bio::Tools::SeqPattern)
perl(Bio::Tools::SeqPattern::Backtranslate)
perl(Bio::Tools::SeqStats)
perl(Bio::Tools::SeqWords)
perl(Bio::Tools::Sigcleave)
perl(Bio::Tools::Signalp)
perl(Bio::Tools::Signalp::ExtendedSignalp)
perl(Bio::Tools::Sim4::Exon)
perl(Bio::Tools::Sim4::Results)
perl(Bio::Tools::Spidey::Exon)
perl(Bio::Tools::Spidey::Results)
perl(Bio::Tools::TandemRepeatsFinder)
perl(Bio::Tools::TargetP)
perl(Bio::Tools::Tmhmm)
perl(Bio::Tools::ipcress)
perl(Bio::Tools::isPcr)
perl(Bio::Tools::pICalculator)
perl(Bio::Tools::tRNAscanSE)
perl(Bio::Tree::AnnotatableNode)
perl(Bio::Tree::Compatible)
perl(Bio::Tree::DistanceFactory)
perl(Bio::Tree::Node)
perl(Bio::Tree::NodeI)
perl(Bio::Tree::NodeNHX)
perl(Bio::Tree::RandomFactory)
perl(Bio::Tree::Statistics)
perl(Bio::Tree::Tree)
perl(Bio::Tree::TreeFunctionsI)
perl(Bio::Tree::TreeI)
perl(Bio::TreeIO)
perl(Bio::TreeIO::NewickParser)
perl(Bio::TreeIO::TreeEventBuilder)
perl(Bio::TreeIO::cluster)
perl(Bio::TreeIO::lintree)
perl(Bio::TreeIO::newick)
perl(Bio::TreeIO::nexus)
perl(Bio::TreeIO::nhx)
perl(Bio::TreeIO::pag)
perl(Bio::TreeIO::phyloxml)
perl(Bio::TreeIO::tabtree)
perl(Bio::UpdateableSeqI)
perl(Bio::WebAgent)
perl(BioPerl)
perl-BioPerl
perl-bioperl

Requires :
perl(AnyDBM_File)
perl(Bio::Align::AlignI)
perl(Bio::Align::PairwiseStatistics)
perl(Bio::Align::StatisticsI)
perl(Bio::Align::Utilities)
perl(Bio::AlignIO)
perl(Bio::AnalysisI)
perl(Bio::AnalysisParserI)
perl(Bio::AnalysisResultI)
perl(Bio::AnnotatableI)
perl(Bio::Annotation::AnnotationFactory)
perl(Bio::Annotation::Collection)
perl(Bio::Annotation::Comment)
perl(Bio::Annotation::DBLink)
perl(Bio::Annotation::OntologyTerm)
perl(Bio::Annotation::Reference)
perl(Bio::Annotation::Relation)
perl(Bio::Annotation::SimpleValue)
perl(Bio::Annotation::TagTree)
perl(Bio::Annotation::Target)
perl(Bio::Annotation::TypeManager)
perl(Bio::AnnotationCollectionI)
perl(Bio::AnnotationI)
perl(Bio::CodonUsage::Table)
perl(Bio::DB::Failover)
perl(Bio::DB::Fasta)
perl(Bio::DB::Flat)
perl(Bio::DB::Flat::BDB)
perl(Bio::DB::GFF::Util::Binning)
perl(Bio::DB::IndexedBase)
perl(Bio::DB::QueryI)
perl(Bio::DB::RandomAccessI)
perl(Bio::DB::Registry)
perl(Bio::DB::SeqI)
perl(Bio::DB::Taxonomy)
perl(Bio::DB::Taxonomy::list)
perl(Bio::DB::WebDBSeqI)
perl(Bio::Das::SegmentI)
perl(Bio::DescribableI)
perl(Bio::Event::EventGeneratorI)
perl(Bio::Event::EventHandlerI)
perl(Bio::Factory::AnalysisI)
perl(Bio::Factory::DriverFactory)
perl(Bio::Factory::FTLocationFactory)
perl(Bio::Factory::LocationFactoryI)
perl(Bio::Factory::ObjectBuilderI)
perl(Bio::Factory::ObjectFactory)
perl(Bio::Factory::ObjectFactoryI)
perl(Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceFactoryI)
perl(Bio::Factory::SequenceProcessorI)
perl(Bio::Factory::SequenceStreamI)
perl(Bio::Factory::TreeFactoryI)
perl(Bio::FeatureHolderI)
perl(Bio::HandlerBaseI)
perl(Bio::IdentifiableI)
perl(Bio::Index::Abstract)
perl(Bio::Index::AbstractSeq)
perl(Bio::Index::EMBL)
perl(Bio::Index::Fasta)
perl(Bio::Index::GenBank)
perl(Bio::Index::SwissPfam)
perl(Bio::Index::Swissprot)
perl(Bio::LocatableSeq)
perl(Bio::Location::Atomic)
perl(Bio::Location::CoordinatePolicyI)
perl(Bio::Location::Fuzzy)
perl(Bio::Location::FuzzyLocationI)
perl(Bio::Location::Simple)
perl(Bio::Location::Split)
perl(Bio::Location::SplitLocationI)
perl(Bio::Location::WidestCoordPolicy)
perl(Bio::LocationI)
perl(Bio::Matrix::Generic)
perl(Bio::Matrix::IO)
perl(Bio::Matrix::MatrixI)
perl(Bio::Matrix::Mlagan)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO)
perl(Bio::Matrix::PSM::InstanceSite)
perl(Bio::Matrix::PSM::InstanceSiteI)
perl(Bio::Matrix::PSM::ProtMatrix)
perl(Bio::Matrix::PSM::Psm)
perl(Bio::Matrix::PSM::PsmHeader)
perl(Bio::Matrix::PSM::PsmHeaderI)
perl(Bio::Matrix::PSM::PsmI)
perl(Bio::Matrix::PSM::SiteMatrix)
perl(Bio::Matrix::PSM::SiteMatrixI)
perl(Bio::Matrix::PhylipDist)
perl(Bio::Matrix::Scoring)
perl(Bio::Ontology::DocumentRegistry)
perl(Bio::Ontology::OBOEngine)
perl(Bio::Ontology::Ontology)
perl(Bio::Ontology::OntologyEngineI)
perl(Bio::Ontology::OntologyI)
perl(Bio::Ontology::OntologyStore)
perl(Bio::Ontology::PathI)
perl(Bio::Ontology::Relationship)
perl(Bio::Ontology::RelationshipFactory)
perl(Bio::Ontology::RelationshipI)
perl(Bio::Ontology::RelationshipType)
perl(Bio::Ontology::SimpleGOEngine::GraphAdaptor)
perl(Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine)
perl(Bio::Ontology::Term)
perl(Bio::Ontology::TermFactory)
perl(Bio::Ontology::TermI)
perl(Bio::OntologyIO)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::BaseSAXHandler)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterProHandler)
perl(Bio::OntologyIO::dagflat)
perl(Bio::ParameterBaseI)
perl(Bio::PrimarySeq)
perl(Bio::PrimarySeqI)
perl(Bio::PullParserI)
perl(Bio::Range)
perl(Bio::RangeI)
perl(Bio::Root::Exception)
perl(Bio::Root::HTTPget)
perl(Bio::Root::IO)
perl(Bio::Root::Root)
perl(Bio::Root::RootI)
perl(Bio::Search::BlastStatistics)
perl(Bio::Search::BlastUtils)
perl(Bio::Search::DatabaseI)
perl(Bio::Search::GenericStatistics)
perl(Bio::Search::HSP::BlastPullHSP)
perl(Bio::Search::HSP::GenericHSP)
perl(Bio::Search::HSP::HSPFactory)
perl(Bio::Search::HSP::HSPI)
perl(Bio::Search::HSP::PullHSPI)
perl(Bio::Search::Hit::BlastPullHit)
perl(Bio::Search::Hit::GenericHit)
perl(Bio::Search::Hit::HitFactory)
perl(Bio::Search::Hit::HitI)
perl(Bio::Search::Hit::PullHitI)
perl(Bio::Search::Iteration::IterationI)
perl(Bio::Search::Result::BlastPullResult)
perl(Bio::Search::Result::CrossMatchResult)
perl(Bio::Search::Result::GenericResult)
perl(Bio::Search::Result::PullResultI)
perl(Bio::Search::Result::ResultFactory)
perl(Bio::Search::Result::ResultI)
perl(Bio::Search::SearchUtils)
perl(Bio::Search::StatisticsI)
perl(Bio::Search::Tiling::MapTileUtils)
perl(Bio::Search::Tiling::TilingI)
perl(Bio::SearchIO)
perl(Bio::SearchIO::EventHandlerI)
perl(Bio::SearchIO::FastHitEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::IteratedSearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchWriterI)
perl(Bio::SearchIO::Writer::ResultTableWriter)
perl(Bio::Seq)
perl(Bio::Seq::LargeLocatableSeq)
perl(Bio::Seq::LargePrimarySeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeqI)
perl(Bio::Seq::Meta)
perl(Bio::Seq::Meta::Array)
perl(Bio::Seq::MetaI)
perl(Bio::Seq::PrimaryQual)
perl(Bio::Seq::PrimedSeq)
perl(Bio::Seq::QualI)
perl(Bio::Seq::Quality)
perl(Bio::Seq::RichSeq)
perl(Bio::Seq::RichSeqI)
perl(Bio::Seq::SeqBuilder)
perl(Bio::Seq::SeqFactory)
perl(Bio::Seq::SeqFastaSpeedFactory)
perl(Bio::Seq::SequenceTrace)
perl(Bio::Seq::TraceI)
perl(Bio::SeqAnalysisParserI)
perl(Bio::SeqFeature::Amplicon)
perl(Bio::SeqFeature::CollectionI)
perl(Bio::SeqFeature::FeaturePair)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Exon)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::ExonI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructureI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Intron)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::NC_Feature)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Transcript)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::TranscriptI)
perl(Bio::SeqFeature::Generic)
perl(Bio::SeqFeature::Primer)
perl(Bio::SeqFeature::Similarity)
perl(Bio::SeqFeature::SimilarityPair)
perl(Bio::SeqFeature::SubSeq)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::IDHandler)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::TypeMapper)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::Unflattener)
perl(Bio::SeqFeatureI)
perl(Bio::SeqI)
perl(Bio::SeqIO)
perl(Bio::SeqIO::FTHelper)
perl(Bio::SeqIO::Handler::GenericRichSeqHandler)
perl(Bio::SeqIO::MultiFile)
perl(Bio::SeqIO::game::featHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameSubs)
perl(Bio::SeqIO::game::gameWriter)
perl(Bio::SeqIO::game::seqHandler)
perl(Bio::SeqIO::gcg)
perl(Bio::SeqIO::tinyseq::tinyseqHandler)
perl(Bio::SeqUtils)
perl(Bio::SimpleAlign)
perl(Bio::SimpleAnalysisI)
perl(Bio::Species)
perl(Bio::Taxon)
perl(Bio::Tools::Alignment::Trim)
perl(Bio::Tools::AnalysisResult)
perl(Bio::Tools::CodonTable)
perl(Bio::Tools::GFF)
perl(Bio::Tools::Genewise)
perl(Bio::Tools::Genomewise)
perl(Bio::Tools::GuessSeqFormat)
perl(Bio::Tools::IUPAC)
perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy::Result)
perl(Bio::Tools::Prediction::Exon)
perl(Bio::Tools::Prediction::Gene)
perl(Bio::Tools::RandomDistFunctions)
perl(Bio::Tools::Run::GenericParameters)
perl(Bio::Tools::Run::ParametersI)
perl(Bio::Tools::Run::WrapperBase)
perl(Bio::Tools::SeqPattern)
perl(Bio::Tools::SeqStats)
perl(Bio::Tools::Signalp)
perl(Bio::Tools::Sim4::Exon)
perl(Bio::Tools::Spidey::Exon)
perl(Bio::Tree::AnnotatableNode)
perl(Bio::Tree::Compatible)
perl(Bio::Tree::Node)
perl(Bio::Tree::NodeI)
perl(Bio::Tree::NodeNHX)
perl(Bio::Tree::Tree)
perl(Bio::Tree::TreeFunctionsI)
perl(Bio::Tree::TreeI)
perl(Bio::TreeIO)
perl(Bio::TreeIO::NewickParser)
perl(Bio::TreeIO::TreeEventBuilder)
perl(Bio::TreeIO::newick)
perl(Bio::WebAgent)
perl(Carp)
perl(DB_File)
perl(Data::Dumper)
perl(Data::Stag)
perl(Digest::MD5)
perl(Dumpvalue)
perl(Error)
perl(Exporter)
perl(Fcntl)
perl(File::Basename)
perl(File::Copy)
perl(File::Path)
perl(File::Spec)
perl(File::Spec::Functions)
perl(File::Temp)
perl(FileHandle)
perl(Getopt::Long)
perl(Graph::Directed)
perl(HTTP::Request::Common)
perl(HTTP::Response)
perl(IO::File)
perl(IO::Handle)
perl(IO::Pipe)
perl(IO::Socket)
perl(IO::String)
perl(IPC::Run)
perl(LWP::UserAgent)
perl(List::MoreUtils)
perl(List::Util)
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perl(POSIX)
perl(Pod::Usage)
perl(Scalar::Util)
perl(Set::Scalar)
perl(Storable)
perl(Symbol)
perl(Test::Builder)
perl(Test::Builder::Module)
perl(Test::Most)
perl(Text::Balanced)
perl(Tie::Handle)
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perl(UNIVERSAL)
perl(URI)
perl(XML::DOM)
perl(XML::LibXML)
perl(XML::LibXML::Reader)
perl(XML::Parser::PerlSAX)
perl(XML::SAX)
perl(XML::SAX::Base)
perl(XML::SAX::Writer)
perl(XML::Twig)
perl(XML::Writer)
perl(YAML)
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perl(constant)
perl(integer)
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perl(parent)
perl(strict)
perl(utf8)
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perl(version)
perl(warnings)
perl-base >= 2:5.34.1
rpmlib(CompressedFileNames) <= 3.0.4-1
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Content of RPM :
/usr/bin/bp_aacomp
/usr/bin/bp_bioflat_index
/usr/bin/bp_biogetseq
/usr/bin/bp_dbsplit
/usr/bin/bp_extract_feature_seq
/usr/bin/bp_fastam9_to_table
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/usr/bin/bp_filter_search
/usr/bin/bp_find-blast-matches
/usr/bin/bp_gccalc
/usr/bin/bp_genbank2gff3
/usr/bin/bp_index
/usr/bin/bp_local_taxonomydb_query
/usr/bin/bp_make_mrna_protein
/usr/bin/bp_mask_by_search
/usr/bin/bp_mrtrans
/usr/bin/bp_mutate
/usr/bin/bp_nexus2nh
/usr/bin/bp_nrdb
/usr/bin/bp_oligo_count
/usr/bin/bp_process_gadfly
/usr/bin/bp_process_sgd
/usr/bin/bp_revtrans-motif
/usr/bin/bp_search2alnblocks
/usr/bin/bp_search2gff
/usr/bin/bp_search2table
/usr/bin/bp_search2tribe
/usr/bin/bp_seq_length
/usr/bin/bp_seqconvert
/usr/bin/bp_seqcut
There is 1120 files more in these RPM.

 
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